RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSA4	YER103W	SHH3	Q04487	196 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSA4	YER103W	TVP18	Q04767	167 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSA4	YER103W	YML053C	Q04978	212 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSA4	YER103W	YLR030W	Q07967	263 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSA4	YER103W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSA4	YER103W	HTB2	P02294	131 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSA4	YER103W	YCR025C	P25352	136 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSA4	YER103W	FIG1	P38224	298 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSA4	YER103W	SAM50	P53969	484 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSA4	YER103W	RCE1	Q03530	315 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSA4	YER103W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSA4	YER103W	CYT1	P07143	309 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	FRM2	P37261	193 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	PRR2	Q12310	699 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	SWM1	Q12379	170 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	YKL075C	P36083	450 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	CFD1	P40558	293 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	AGE1	Q04412	482 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	CSI2	Q08054	341 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	RLM1	Q12224	676 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	SPO13	P23624	291 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	MNS1	P32906	549 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	YAL037W	P39728	267 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	APS2	Q00381	147 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	YBR197C	P38306	217 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	LST7	P53237	242 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	YGR151C	P53287	111 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	AHT1	P29589	182 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	TCA17	P32613	152 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	SKP1	P52286	194 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	GIS1	Q03833	894 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	STP4	Q07351	490 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	WTM2	Q12206	467 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	MDH2	P22133	377 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	ERG2	P32352	222 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	AQR1	P53943	586 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	YDR366C	P87287	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	NCE101	Q02820	53 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	STS1	P38637	319 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	MNL1	P38888	796 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	CUZ1	P53899	274 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	STP3	Q05937	343 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	GIC2	Q06648	383 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	REX3	Q12090	404 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	YLL053C	P0CD98	152 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	AIM29	P36154	155 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	POP7	P38291	140 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	ENB1	Q08299	606 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	GAL7	P08431	366 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	MIG1	P27705	504 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	YEL057C	P39983	233 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	TUB4	P53378	473 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	HOL1	P53389	586 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	DAD3	P69850	94 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	HIT1	P46973	164 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	HHT1	P61830	136 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	MCH1	Q07376	486 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	YOR343C	Q12484	108 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSA4	YER103W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	DAL3	P32459	195 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	MKK2	P32491	506 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	YMR262W	P38430	313 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	YHR180W	P38868	163 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	DFG5	Q05031	458 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	MCP1	Q12106	302 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	YGL010W	P25338	174 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	VMA3	P25515	160 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	YER188W	P40103	239 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	SNO2	P53823	222 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	PAU23	Q07987	124 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	PAU17	Q12370	124 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	ISA2	Q12425	185 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	COX5B	P00425	151 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	SPO7	P18410	259 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	AFG1	P32317	509 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SSA4	YER103W	REC114	P32841	428 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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