RNA–Protein interactions for RNA: YEL065W

SIT1, Transcript of Ferrioxamine B transporter, yeast

Gene SIT1, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIT1	YEL065W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	POP4	P38336	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	FCY21	P40039	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	VPS25	P47142	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YGR035C	P53222	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	MHP1	P43638	1398 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	CYC3	P06182	269 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	STE7	P06784	515 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	SNF4	P12904	322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	ATG22	P25568	528 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	PRY2	P36110	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	PGD1	P40356	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YGR018C	P53211	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	GPI17	Q04080	534 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	HCM1	P25364	564 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	MRPL17	P36528	281 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	NAT2	P37293	288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	MEP2	P41948	499 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YGL101W	P53144	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YGL082W	P53155	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	PIR3	Q03180	325 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	EAF3	Q12432	401 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	NUP192	P47054	1683 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	TOD6	P34219	525 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YKL102C	P34249	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	OAR1	P35731	278 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YEA4	P40004	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	AVT7	P40501	490 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	SOL1	P50278	321 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YGL034C	P53186	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	PSK1	P31374	1356 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	SIR2	P06700	562 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	MSI1	P13712	422 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YCR025C	P25352	136 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	RIP-Chip
SIT1	YEL065W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	APQ12	P40532	138 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	SDT1	P53078	280 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	ATP14	Q12349	124 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	RFC2	P40348	353 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	ERV29	P53337	310 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	CWC27	Q02770	301 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	DGA1	Q08650	418 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	IES3	Q12345	250 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	MRP49	P32388	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	PTM1	P32857	523 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	MIX23	P38162	196 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	VMA7	P39111	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	BIR1	P47134	954 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	BOR1	P53838	576 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	NSG2	P53898	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	RNH201	P53942	307 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	NKP2	Q06162	153 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	IES4	Q08561	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	HIS3	P06633	220 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	PHO2	P07269	559 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	MRS3	P10566	314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YGR050C	P53231	118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	AAH1	P53909	347 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	PRR2	Q12310	699 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	CNB1	P25296	175 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	MNN5	P46982	586 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	ATP16	Q12165	160 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIT1	YEL065W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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