RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637015.1

ARID1B-223, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene ARID1B, Length 5,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-223	ENST00000637015	SPATA17	Q96L03	361 aa		12.98	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	VCPKMT	Q9H867	229 aa		12.98	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		12.98	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		12.98	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	KIT	P10721	976 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	HPCA	P84074	193 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	PTPRN2	Q92932	1015 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	ECT2	Q9H8V3	914 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	PHF2	O75151	1096 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	NEK2	P51955	445 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	FCGRT	P55899	365 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	C16orf89	Q6UX73	402 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	UCMA	Q8WVF2	138 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	DPP7	Q9UHL4	492 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	LAMC1	P11047	1609 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	NR3C2	P08235	984 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	TP53BP2	Q13625	1128 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	HIC1	Q14526	733 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	VPS33B	Q9H267	617 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	NMT2	O60551	498 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	RGS2	P41220	211 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	TMED1	Q13445	227 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	IL31	Q6EBC2	164 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	CENPP	Q6IPU0	288 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	POTEA	Q6S8J7	498 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	ZFP42	Q96MM3	310 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM196B	A6NMK8	535 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	VPS72	Q15906	364 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	TRIM60	Q495X7	471 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	GPRASP2	Q96D09	838 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM161B	Q96MY7	647 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	TSC22D3	Q99576	134 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		12.97	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	PREX2	Q70Z35	1606 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	USP31	Q70CQ4	1352 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	RASSF10	A6NK89	507 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	TRIM49	P0CI25	452 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	TRIM49C	P0CI26	452 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	RNF135	Q8IUD6	432 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	RGL1	Q9NZL6	768 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	CYP26A1	O43174	497 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	NCKAP1L	P55160	1127 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	CENPC	Q03188	943 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	MTA1	Q13330	715 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	NCAPH	Q15003	741 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	SPACA6	W5XKT8	324 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		12.96	□□□□□ -0.33
ARID1B-223	ENST00000637015	EXTL3	O43909	919 aa		12.96	□□□□□ -0.34
ARID1B-223	ENST00000637015	HOXC6	P09630	235 aa		12.96	□□□□□ -0.34
ARID1B-223	ENST00000637015	ODC1	P11926	461 aa		12.96	□□□□□ -0.34
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.34
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC18A3	Q16572	532 aa		12.96	□□□□□ -0.34
ARID1B-223	ENST00000637015	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.34
ARID1B-223	ENST00000637015	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		12.96	□□□□□ -0.34
ARID1B-223	ENST00000637015	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		12.96	□□□□□ -0.34
ARID1B-223	ENST00000637015	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.34
ARID1B-223	ENST00000637015	SGSM3	Q96HU1	749 aa		12.96	□□□□□ -0.34

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