RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	EDN1	P05305	212 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	NUDT17	P0C025	328 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	CREB1	P16220	341 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	GLRA2	P23416	452 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	TAS2R40	P59535	323 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	BAG6	P46379	1132 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	ITGA8	P53708	1063 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	OSTN	P61366	133 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	ZACN	Q401N2	412 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	REPS2	Q8NFH8	660 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	RDM1	Q8NG50	284 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	ART4	Q93070	314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	ITFG2	Q969R8	447 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	HAUS1	Q96CS2	278 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	KRT10	P13645	584 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	FBXO41	Q8TF61	875 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	SCLT1	Q96NL6	688 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	MAFG	O15525	162 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	RARG	P13631	454 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	TCF4	P15884	667 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	GTF2H1	P32780	548 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	TNFSF9	P41273	254 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	FNTA	P49354	379 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	CUL2	Q13617	745 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	GGT7	Q9UJ14	662 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	FSCN2	O14926	492 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	TCEAL1	Q15170	157 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	CYP1B1	Q16678	543 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	C9orf72	Q96LT7	481 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	LRRC19	Q9H756	370 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	OAT	P04181	439 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	ATF2	P15336	505 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	ADCY2	Q08462	1091 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	PSMD6	Q15008	389 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	STXBP2	Q15833	593 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	AAAS	Q9NRG9	546 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SMTN-222	ENST00000612341	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF365	Q70YC5	407 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	GGA3	Q9NZ52	723 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	GAS8	O95995	478 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SMTN-222	ENST00000612341	PSMC4	P43686	418 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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