RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601769.5

CD22-231, Transcript of CD22 molecule, human

TSL 2

Gene CD22, Length 3,060 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CD22-231	ENST00000601769	CCDC151	A5D8V7	595 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	MYBL2	P10244	700 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	PAFAH1B1	P43034	410 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	MARCKSL1	P49006	195 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	GUCY2F	P51841	1108 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	JADE1	Q6IE81	842 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	TRPV1	Q8NER1	839 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	SIX4	Q9UIU6	781 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	MYADML2	A6NDP7	307 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	CEP104	O60308	925 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ZEB2	O60315	1214 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	B4GALT4	O60513	344 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	IGHA2	P01877	340 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	MYL3	P08590	195 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	CAP1	Q01518	475 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	MFSD10	Q14728	455 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	BRD3	Q15059	726 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	NAA35	Q5VZE5	725 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	APBA2	Q99767	749 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	NUP85	Q9BW27	656 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	AMFR	Q9UKV5	643 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	WEE2	P0C1S8	567 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	GNA15	P30679	374 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	RGS2	P41220	211 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	CBX1	P83916	185 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ITIH3	Q06033	890 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ZNF394	Q53GI3	561 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	AADACL2	Q6P093	401 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	TRIM7	Q9C029	511 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	SCN1A	P35498	2009 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	CYP1A2	P05177	515 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	MCF2	P10911	925 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	AP3M2	P53677	418 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	TUBB4B	P68371	445 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	MESD	Q14696	234 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	WDR93	Q6P2C0	686 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	USP38	Q8NB14	1042 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ALG3	Q92685	438 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	KRT35	Q92764	455 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	OSMR	Q99650	979 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	GABRQ	Q9UN88	632 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ALG6	Q9Y672	507 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	TREH	O43280	583 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	THAP12	O43422	761 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	GPR32	O75388	356 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ERLIN2	O94905	339 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	KRT19	P08727	400 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ASPA	P45381	313 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	PSEN2	P49810	448 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ZNF132	P52740	706 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	TRPC3	Q13507	836 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	SURF1	Q15526	300 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ZNF699	Q32M78	642 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	FAM81B	Q96LP2	452 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	FUT8	Q9BYC5	575 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	TNNC2	P02585	160 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	CYP2C9	P11712	490 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	TCEAL1	Q15170	157 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	NME8	Q8N427	588 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	CXorf38	Q8TB03	319 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CD22-231	ENST00000601769	KRT12	Q99456	494 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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