RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 GRM2Q14416 872 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CTXN3Q4LDR2 81 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM78AQ5JUQ0 283 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 RINT1Q6NUQ1 792 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TSSK4Q6SA08 328 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ASB16Q96NS5 453 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TCHPQ9BT92 498 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 RUSC1Q9BVN2 902 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 RAB34Q9BZG1 259 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 EPC1Q9H2F5 836 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 BRD9Q9H8M2 597 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 C17orf75Q9HAS0 396 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 F5P12259 2224 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PP2D1A8MPX8 630 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MAN2B1O00754 1011 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC16A4O15374 487 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 HARSP12081 509 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MCM4P33991 863 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MTAPQ13126 283 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PTGDRQ13258 359 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP4A22Q5TCH4 519 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT79Q5XKE5 535 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 IQCEQ6IPM2 695 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF280DQ6N043 979 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MAP4K3Q8IVH8 894 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ELMOD1Q8N336 334 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 APPL2Q8NEU8 664 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX12PQ92771 950 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 IRF7Q92985 503 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D32Q96NH3 1257 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CHRDQ9H2X0 955 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TRPV5Q9NQA5 729 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MAFFQ9ULX9 164 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 LAD1O00515 517 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MOSPD3O75425 235 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TOM1L1O75674 476 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TDGF1P13385 188 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMC3P17980 439 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 GUCY2CP25092 1073 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CDC25AP30304 524 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PRPHP41219 470 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 EPHA5P54756 1037 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TWF1Q12792 350 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 IL17AQ16552 155 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 VITQ6UXI7 678 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNK18Q7Z418 384 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM184AQ8NB25 1140 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 LEMD2Q8NC56 503 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SMARCD2Q92925 531 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ZSWIM3Q96MP5 696 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 IER2Q9BTL4 223 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TIPINQ9BVW5 301 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CEP72Q9P209 647 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SFI1A8K8P3 1242 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 M0QZQ0 153 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SEC24BO95487 1268 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PLS3P13797 630 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CPB1P15086 417 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SDHBP21912 280 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 GDI1P31150 447 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 VIPR2P41587 438 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MCL1Q07820 350 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 STRN3Q13033 797 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SEZ6Q53EL9 994 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ZPBP2Q6X784 338 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 BEST2Q8NFU1 509 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms