RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 NUB1Q9Y5A7 615 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 INSL5Q9Y5Q6 135 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 NCANO14594 1321 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 VWA3AA6NCI4 1184 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 ECI2O75521 394 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 LRG1P02750 347 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 TARSP26639 723 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 RPL9P32969 192 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 PRKCQQ04759 706 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 GRM2Q14416 872 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 CTXN3Q4LDR2 81 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 TMEM119Q4V9L6 283 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 MCTP1Q6DN14 999 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 TPRG1Q6ZUI0 275 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 TCEAL8Q8IYN2 117 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 DDX12PQ92771 950 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 TIPINQ9BVW5 301 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 GDE1Q9NZC3 331 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 FAM170BA6NMN3 283 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 MOSPD3O75425 235 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 VNN2O95498 520 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 PTPN2P17706 415 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 ELF1P32519 619 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 TNFSF9P41273 254 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 GUCY2FP51841 1108 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 PFKPQ01813 784 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 MCL1Q07820 350 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 ADCY1Q08828 1119 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 STRN3Q13033 797 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 RILPL1Q5EBL4 403 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 ARSHQ5FYA8 562 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 FAM78AQ5JUQ0 283 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 ZNF280DQ6N043 979 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 HS6ST3Q8IZP7 471 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 ZSWIM3Q96MP5 696 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 SEMA4AQ9H3S1 761 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 HEBP1Q9NRV9 189 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 CEP72Q9P209 647 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-208ENST00000590422 TTC26A0AVF1 554 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 H7C4K7 107 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 FAM189A1O60320 539 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 OR4Q2P0C623 313 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 PLA2G4BP0C869 781 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 GJA1P17302 382 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 ID4P47928 161 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 TWF1Q12792 350 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 RABEP1Q15276 862 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 ZPBP2Q6X784 338 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 KIAA2013Q8IYS2 634 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 DCLK2Q8N568 766 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 SUMF1Q8NBK3 374 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 ELSPBP1Q96BH3 223 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 ASB16Q96NS5 453 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 BCO2Q9BYV7 579 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 CRISPLD1Q9H336 500 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 PCDHB8Q9UN66 801 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 SCN1AP35498 2009 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 M0QZQ0 153 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 PPEF2O14830 753 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 CLDN3O15551 220 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 CPB1P15086 417 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 NCKAP1LP55160 1127 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 FZD5Q13467 585 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 TPGS2Q68CL5 300 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 ZNF687Q8N1G0 1237 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 CLDN23Q96B33 292 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 RMDN1Q96DB5 314 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 KIF12Q96FN5 646 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 TMX3Q96JJ7 454 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 PGLYRP2Q96PD5 576 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 REEP2Q9BRK0 252 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 OSBPL6Q9BZF3 934 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 YIPF1Q9Y548 306 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 LAMTOR5O43504 91 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 CLTAP09496 248 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 GJB2P29033 226 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 LRPAP1P30533 357 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 VIPR2P41587 438 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 SMTNP53814 917 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 EPHA5P54756 1037 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 GRIN1Q05586 938 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 ZBTB6Q15916 424 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 SLC39A4Q6P5W5 647 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-208ENST00000590422 TSSK4Q6SA08 328 aa13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms