RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578528.1

RPL17-201, Transcript of ribosomal protein L17, humanhuman

TSL 3

Gene RPL17, Length 481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17-201ENST00000578528 LRRC52Q8N7C0 313 aa25.19■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 RNF214Q8ND24 703 aa25.19■■□□□ 1.62
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RPL17-201ENST00000578528 COLEC11Q9BWP8 271 aa25.19■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 MARCH5Q9NX47 278 aa25.19■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 C5orf67F2Z3F1 127 aa25.18■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 PPEF2O14830 753 aa25.18■■□□□ 1.62
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RPL17-201ENST00000578528 SCN1AP35498 2009 aa25.18■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 PHACTR2O75167 634 aa25.17■■□□□ 1.62
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RPL17-201ENST00000578528 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
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RPL17-201ENST00000578528 B3GAT3O94766 335 aa25.16■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 HLA-DRAP01903 254 aa25.16■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 RB1P06400 928 aa25.16■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 KRT19P08727 400 aa25.16■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 ATICP31939 592 aa25.16■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 PBX3P40426 434 aa25.16■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 TRPC3Q13507 836 aa25.16■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 EPC2Q52LR7 807 aa25.16■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
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RPL17-201ENST00000578528 RABGGTAQ92696 567 aa25.16■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 TIFAQ96CG3 184 aa25.16■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 IGSF21Q96ID5 467 aa25.16■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 XYLT2Q9H1B5 865 aa25.16■■□□□ 1.62
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RPL17-201ENST00000578528 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa25.15■■□□□ 1.62
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RPL17-201ENST00000578528 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 TAF4BQ92750 862 aa25.15■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 C17orf80Q9BSJ5 609 aa25.15■■□□□ 1.62
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RPL17-201ENST00000578528 SLC28A3Q9HAS3 691 aa25.15■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 LGALS16A8MUM7 142 aa25.14■■□□□ 1.62
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RPL17-201ENST00000578528 CTNNB1P35222 781 aa25.14■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 PIK3CAP42336 1068 aa25.14■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 PLCB3Q01970 1234 aa25.14■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 CETN1Q12798 172 aa25.14■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa25.14■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 PPP2R2DQ66LE6 453 aa25.14■■□□□ 1.62
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RPL17-201ENST00000578528 SEMA4DQ92854 862 aa25.14■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 RAB20Q9NX57 234 aa25.14■■□□□ 1.62
RPL17-201ENST00000578528 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
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RPL17-201ENST00000578528 SPTLC1O15269 473 aa25.13■■□□□ 1.61
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RPL17-201ENST00000578528 TMEM265A0A087WTH1 108 aa25.12■■□□□ 1.61
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RPL17-201ENST00000578528 FGF18O76093 207 aa25.12■■□□□ 1.61
RPL17-201ENST00000578528 FUT10Q6P4F1 479 aa25.12■■□□□ 1.61
RPL17-201ENST00000578528 KLHL23Q8NBE8 558 aa25.12■■□□□ 1.61
RPL17-201ENST00000578528 TMEM169Q96HH4 297 aa25.12■■□□□ 1.61
RPL17-201ENST00000578528 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
RPL17-201ENST00000578528 STK39Q9UEW8 545 aa25.12■■□□□ 1.61
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