RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 KLK7P49862 253 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 GUCY2FP51841 1108 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 MYL6P60660 151 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 PTPN21Q16825 1174 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 WDR44Q5JSH3 913 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 RASIP1Q5U651 963 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 NEK11Q8NG66 645 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 COL4A6Q14031 1691 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 LRRN2O75325 713 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 NOL4O94818 638 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 UPP2O95045 317 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 KRT19P08727 400 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 PAX3P23760 479 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 TRIM14Q14142 442 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 TMC6Q7Z403 805 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 FAM81BQ96LP2 452 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 GANQ9H2C0 597 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 IMPACTQ9P2X3 320 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 A0A1W2PQJ5 194 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 ZBBXA8MT70 800 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 DDHD2O94830 711 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 RFX1P22670 979 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 PNPLA4P41247 253 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 NT5C1BQ96P26 610 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 SLC9A7Q96T83 725 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 UCHL3P15374 230 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 GATMP50440 423 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 GCNT1Q02742 428 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 MYO1EQ12965 1108 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 UPP1Q16831 310 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF699Q32M78 642 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 DRC7Q8IY82 874 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 LRRC43Q8N309 656 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 TATDN2Q93075 761 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 HPDLQ96IR7 371 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF560Q96MR9 790 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 CEP72Q9P209 647 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 PODXLO00592 558 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 PPEF2O14830 753 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 EPHB6O15197 1021 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 GJB5O95377 273 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 CLCNKBP51801 687 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 GYPCP04921 128 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 TAF6P49848 677 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 APBA1Q02410 837 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 LRMPQ12912 555 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms