RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565243.2

RNPS1-213, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 3,337 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-213	ENST00000565243	MUT	P22033	750 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	MFAP3	P55082	362 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	P3H1	Q32P28	736 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	RELL1	Q8IUW5	271 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	ZNF276	Q8N554	614 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	TMEM206	Q9H813	350 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	DACT2	Q5SW24	774 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	ATL2	Q8NHH9	583 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	ENTPD5	O75356	428 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	MYBL1	P10243	752 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	KRT10	P13645	584 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	MAGEA4	P43358	317 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	STRN3	Q13033	797 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	SV2A	Q7L0J3	742 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	MON1B	Q7L1V2	547 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	PTPRJ	Q12913	1337 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	MAPK6	Q16659	721 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	KRT39	Q6A163	491 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	PASD1	Q8IV76	773 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	BATF3	Q9NR55	127 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	RAB20	Q9NX57	234 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	TYROBP	O43914	113 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	ATP5D	P30049	168 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	GJC1	P36383	396 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	UTRN	P46939	3433 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243		H0Y3Z8	333 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	NFIB	O00712	420 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	MAPK13	O15264	365 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	KRT5	P13647	590 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	PEX19	P40855	299 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	TAF11	Q15544	211 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	PARP6	Q2NL67	630 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	OGFOD1	Q8N543	542 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	IFT74	Q96LB3	600 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	LRRC42	Q9Y546	428 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	ZNF536	O15090	1300 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	DPPA5	A6NC42	116 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	CETN1	Q12798	172 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	PTP4A2	Q12974	167 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	LONP2	Q86WA8	852 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
RNPS1-213	ENST00000565243	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-213	ENST00000565243	ATP9A	O75110	1047 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-213	ENST00000565243	CALB2	P22676	271 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-213	ENST00000565243	CNGA1	P29973	690 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-213	ENST00000565243	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-213	ENST00000565243	GPX6	P59796	221 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-213	ENST00000565243	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37

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