RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549302.1

ARL1-206, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 1, human

TSL 3

Gene ARL1, Length 725 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARL1-206	ENST00000549302	PPP2R5C	Q13362	524 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	EPHA7	Q15375	998 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	INF2	Q27J81	1249 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	PDXDC1	Q6P996	788 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	CEP57	Q86XR8	500 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	C4orf19	Q8IY42	314 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	CPB2	Q96IY4	423 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	B3GALT6	Q96L58	329 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	NELL2	Q99435	816 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	LXN	Q9BS40	222 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	RAB23	Q9ULC3	237 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	USP3	Q9Y6I4	520 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	NID2	Q14112	1375 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	CEP250	Q9BV73	2442 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	CACNA1B	Q00975	2339 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	DEXI	O95424	95 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	C8A	P07357	584 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	RPS6KB1	P23443	525 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	AKAP5	P24588	427 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	PTEN	P60484	403 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	LMNB2	Q03252	620 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	GRIK3	Q13003	919 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	NTRK3	Q16288	839 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	LILRA6	Q6PI73	481 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	PARM1	Q6UWI2	310 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	TPH2	Q8IWU9	490 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	FBXL16	Q8N461	479 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	MBOAT7	Q96N66	472 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	ZMYND15	Q9H091	742 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	MIOS	Q9NXC5	875 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	USP18	Q9UMW8	372 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	EVPL	Q92817	2033 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	DMD	P11532	3685 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	ZNF292	O60281	2723 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302		F8W810	466 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	TBX3	O15119	743 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	CCL16	O15467	120 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	SLC37A4	O43826	429 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	LRRN2	O75325	713 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	PAPLN	O95428	1278 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	NPTXR	O95502	500 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	GLUL	P15104	373 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	HOXA9	P31269	272 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	CYP4A11	Q02928	519 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	POU5F1B	Q06416	359 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	GAS6	Q14393	721 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	PPP2R5D	Q14738	602 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	NEK8	Q86SG6	692 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	PGBD3	Q8N328	593 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	RABGGTA	Q92696	567 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	FGF13	Q92913	245 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	FGF14	Q92915	247 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	RUBCNL	Q9H714	662 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	KLK14	Q9P0G3	267 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	VAV3	Q9UKW4	847 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARL1-206	ENST00000549302	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARL1-206	ENST00000549302	TBC1D4	O60343	1298 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARL1-206	ENST00000549302	CDKL5	O76039	1030 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARL1-206	ENST00000549302	EFEMP2	O95967	443 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARL1-206	ENST00000549302	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ARL1-206	ENST00000549302	NRL	P54845	237 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARL1-206	ENST00000549302	NTHL1	P78549	312 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARL1-206	ENST00000549302	TUSC3	Q13454	348 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARL1-206	ENST00000549302	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ARL1-206	ENST00000549302	PSMD5	Q16401	504 aa		10.64	□□□□□ -0.71

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