RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546120.2

UBC-213, Transcript of ubiquitin C, human

TSL 5 BASIC

Gene UBC, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBC-213	ENST00000546120	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SPOP	O43791	374 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	KRT36	O76013	467 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	CAMTA2	O94983	1202 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	KLHL2	O95198	593 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ESRRB	O95718	433 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	NR3C1	P04150	777 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	IVD	P26440	423 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ADCY7	P51828	1080 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	GSTO1	P78417	241 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	WDR78	Q5VTH9	848 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ARMC3	Q5W041	872 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ATG16L1	Q676U5	607 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TTC27	Q6P3X3	843 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	MPP4	Q96JB8	637 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	DNAJC18	Q9H819	358 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	AAAS	Q9NRG9	546 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	DNM3	Q9UQ16	869 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	NR2E1	Q9Y466	385 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	AK5	Q9Y6K8	562 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		10.75	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	PAPPA	Q13219	1627 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	KLRF2	D3W0D1	207 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	PIK3CD	O00329	1044 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ALOX15B	O15296	676 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	FAM189A1	O60320	539 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	CBX6	O95503	412 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	VCL	P18206	1134 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	CYP3A7	P24462	503 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TTK	P33981	857 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ITGA8	P53708	1063 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	INHBC	P55103	352 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SESN3	P58005	492 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	CDC16	Q13042	620 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	USP4	Q13107	963 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	MMEL1	Q495T6	779 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	LGSN	Q5TDP6	509 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	PACS1	Q6VY07	963 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	PODN	Q7Z5L7	613 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	FNDC8	Q8TC99	324 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	MTBP	Q96DY7	904 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	C7orf26	Q96N11	449 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	MIPEP	Q99797	713 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	GIN1	Q9NXP7	522 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	HEY2	Q9UBP5	337 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		10.74	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		10.73	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		10.73	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120		A0A0J9YVX5	310 aa		10.73	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120		A0A1B0GVG6	124 aa		10.73	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	FAM196B	A6NMK8	535 aa		10.73	□□□□□ -0.69

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