RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	PPM1A	P35813	382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	STAT5B	P51692	787 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	TLE1	Q04724	770 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	BTK	Q06187	659 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308		Q6ZUG5	572 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	LDAH	Q9H6V9	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308		Q9UFV3	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	GLI2	P10070	1586 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	POM121B	A6NF01	834 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	ADCY6	O43306	1168 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PHF2	O75151	1096 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	FSBP	O95073	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	NPR1	P16066	1061 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	TSHR	P16473	764 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	MAL	P21145	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	SREBF1	P36956	1147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	STT3A	P46977	705 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	FMO1	Q01740	532 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPRG	P23470	1445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAMTS12	P58397	1594 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PPL8	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308		H0Y858	1186 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC7A1	P30825	629 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	KLF10	Q13118	480 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB39A	Q14964	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CNGA2	Q16280	664 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A087WV62	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	NPHP1	O15259	732 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXS1	O43638	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	FGF18	O76093	207 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	ARIH2	O95376	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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