RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 I3L4J1 428 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 GJB2P29033 226 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 ZNF528Q3MIS6 628 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 MCTP1Q6DN14 999 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 ZNF280DQ6N043 979 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 BRAPQ7Z569 592 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 C1orf210Q8IVY1 113 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 NELL2Q99435 816 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 POLIQ9UNA4 740 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 GPR179Q6PRD1 2367 aa20.35■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 ZNF197O14709 1029 aa20.34■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 LRG1P02750 347 aa20.34■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 FOXK2Q01167 660 aa20.34■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.34■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 DNASE1L2Q92874 299 aa20.34■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.34■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.34■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.34■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.34■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 TSC2P49815 1807 aa20.34■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 SCN1AP35498 2009 aa20.34■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 GLULP15104 373 aa20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 ELF1P32519 619 aa20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 CD302Q8IX05 232 aa20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 DDX12PQ92771 950 aa20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 CLDN23Q96B33 292 aa20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 FIZ1Q96SL8 496 aa20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
LTBR-211ENST00000543190 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.32■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 H3BQV1 296 aa20.32■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 PRRG1O14668 218 aa20.32■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 SEC24AO95486 1093 aa20.32■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.32■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 POTEHQ6S545 545 aa20.32■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 CALML4Q96GE6 196 aa20.32■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 REEP2Q9BRK0 252 aa20.32■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 PARVGQ9HBI0 331 aa20.32■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 FBXO4Q9UKT5 387 aa20.32■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 TBX20Q9UMR3 447 aa20.32■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 A0A0B4J269 797 aa20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 STK25O00506 426 aa20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 OGTO15294 1046 aa20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 CXCL8P10145 99 aa20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 RFX1P22670 979 aa20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 FCARP24071 287 aa20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 MCM4P33991 863 aa20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 UBA7P41226 1012 aa20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 GTF2BQ00403 316 aa20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 DERAQ9Y315 318 aa20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 DCNP07585 359 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 SP9P0CG40 484 aa20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 TYMPP19971 482 aa20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 LRRC15Q8TF66 581 aa20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 NELL1Q92832 810 aa20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 ASB16Q96NS5 453 aa20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 KXD1Q9BQD3 176 aa20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 GPR88Q9GZN0 384 aa20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.3■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 TCHHQ07283 1943 aa20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.29■□□□□ 0.84
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