RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538266.5

SNHG1-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG1, Length 347 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-208	ENST00000538266	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	UBXN4	Q92575	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	EPN3	Q9H201	632 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ASTN1	O14525	1302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	LCT	P09848	1927 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	MCM3AP	O60318	1980 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	AGRP	O00253	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PDPK1	O15530	556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SEPT4	O43236	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	FIBP	O43427	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	MARCH6	O60337	910 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ITGAV	P06756	1048 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TGFB3	P10600	412 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	RARB	P10826	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CYBA	P13498	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CCL5	P13501	91 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	AKR1A1	P14550	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	RAC2	P15153	192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SYT1	P21579	422 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	EDNRB	P24530	442 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63	2e-8	■■■■□ 21.3
SNHG1-208	ENST00000538266	MCM7	P33993	719 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	DDIT3	P35638	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ERVFC1	P60507	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	DUSP4	Q13115	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NPY5R	Q15761	445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PRR16	Q569H4	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	RTP2	Q5QGT7	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	XP32	Q5T750	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	OXR1	Q8N573	874 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SHISA4	Q96DD7	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	MAFG	O15525	162 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	NEMF	O60524	1076 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	GH1	P01241	217 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	CYP3A4	P08684	503 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	IFNGR1	P15260	489 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	ITGB5	P18084	799 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-208	ENST00000538266	CIITA	P33076	1130 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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