RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 LEMD2Q8NC56 503 aa15.6■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 DEPTORQ8TB45 409 aa15.6■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa15.6■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 C8orf76Q96K31 380 aa15.6■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 CXCL16Q9H2A7 254 aa15.6■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 MYH11P35749 1972 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 I3L4J1 428 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 ABLIM3O94929 683 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 BRCC3P46736 316 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 YARSP54577 528 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 ARPP19P56211 112 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 SATB1Q01826 763 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 DMWDQ09019 674 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 BECN1Q14457 450 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 LONP2Q86WA8 852 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 SPEM1Q8N4L4 309 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 E2F7Q96AV8 911 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 TCEAL4Q96EI5 215 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 INSL5Q9Y5Q6 135 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-202ENST00000525711 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 WNT7AO00755 349 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 SYN3O14994 580 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 CHRNB1P11230 501 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 CCNE1P24864 410 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 FNTBP49356 437 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 EFNA5P52803 228 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 NR5A1Q13285 461 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 EEF1DP3Q658K8 133 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 TPGS2Q68CL5 300 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 POTEHQ6S545 545 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 CEP68Q76N32 757 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 MFSD6LQ8IWD5 586 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 YAF2Q8IY57 180 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 C3orf58Q8NDZ4 430 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 NACC1Q96RE7 527 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 GPR88Q9GZN0 384 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 TUFT1Q9NNX1 390 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 ASAH2Q9NR71 780 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC38A7Q9NVC3 462 aa15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A087WWV3 80 aa15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 PDCP20941 246 aa15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 PTGDRQ13258 359 aa15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 ATF7IP2Q5U623 682 aa15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM200AQ8TCP9 573 aa15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 IFT74Q96LB3 600 aa15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 MTMR9Q96QG7 549 aa15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 TRPV4Q9HBA0 871 aa15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 MAFFQ9ULX9 164 aa15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 NUB1Q9Y5A7 615 aa15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 CHD6Q8TD26 2715 aa15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 EML5Q05BV3 1969 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 ARHGEF35A5YM69 484 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 BTBD18B2RXH4 712 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 PODXLO00592 558 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 HRO43593 1189 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 GDF9O60383 454 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 SEC24AO95486 1093 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 MYL4P12829 197 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 CCR2P41597 374 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 DGKKQ5KSL6 1271 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF280DQ6N043 979 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 PADI6Q6TGC4 694 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 CD300LGQ6UXG3 332 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 ERMNQ8TAM6 284 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 BSNDQ8WZ55 320 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 USP20Q9Y2K6 914 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 EDN1P05305 212 aa15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 CYP11B2P19099 503 aa15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 VIPR2P41587 438 aa15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 LIMK1P53667 647 aa15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 TWF1Q12792 350 aa15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 GAS6Q14393 721 aa15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-202ENST00000525711 CTXN3Q4LDR2 81 aa15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms