RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522399.1

TTC13-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

TSL 4

Gene TTC13, Length 529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-208ENST00000522399 ANGPT1Q15389 498 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 TCEAL8Q8IYN2 117 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 RAD54LQ92698 747 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 DDX12PQ92771 950 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 KIF12Q96FN5 646 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 SHDQ96IW2 340 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 PCDHB8Q9UN66 801 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 DMDP11532 3685 aa26.91■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 XPOTO43592 962 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 TRAK2O60296 914 aa26.91■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 TBCAO75347 108 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 PDCP20941 246 aa26.91■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 MCM6Q14566 821 aa26.91■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 ING5Q8WYH8 240 aa26.91■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 ZHX3Q9H4I2 956 aa26.91■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 GDE1Q9NZC3 331 aa26.91■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 SIT1Q9Y3P8 196 aa26.91■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 OGTO15294 1046 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 PIGRP01833 764 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 CYP3A5P20815 502 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 LRPAP1P30533 357 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 TNFSF9P41273 254 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 GRIN1Q05586 938 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 SPAG1Q07617 926 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 LRRC15Q8TF66 581 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 TSPAN18Q96SJ8 248 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 MAFFQ9ULX9 164 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 INSL5Q9Y5Q6 135 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 PFKPQ01813 784 aa26.89■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 ZBTB6Q15916 424 aa26.89■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 FRMD5Q7Z6J6 570 aa26.89■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 ELMOD1Q8N336 334 aa26.89■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 KXD1Q9BQD3 176 aa26.89■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
TTC13-208ENST00000522399 LACTBL1A8MY62 500 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 M0QZQ0 153 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 SEC24AO95486 1093 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 CPB1P15086 417 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 STARD6P59095 220 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 CUL4AQ13619 759 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 SLC5A9Q2M3M2 681 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 SPECC1Q5M775 1068 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 MCRS1Q96EZ8 462 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 CORO1BQ9BR76 489 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 MSTO1Q9BUK6 570 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 CCSER1Q9C0I3 900 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 FAM186AA6NE01 2351 aa26.87■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 PRR23AA6NEV1 266 aa26.87■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 ZNF197O14709 1029 aa26.87■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 ADCY1Q08828 1119 aa26.87■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 IQCEQ6IPM2 695 aa26.87■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 ASCL5Q7RTU5 278 aa26.87■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 CD302Q8IX05 232 aa26.87■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 A0A0B4J269 797 aa26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 FAM189A1O60320 539 aa26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 ECI2O75521 394 aa26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 DCNP07585 359 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 CEBPBP17676 345 aa26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 DDIT3P35638 169 aa26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 GTF2BQ00403 316 aa26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 PRKCQQ04759 706 aa26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 CYP4A22Q5TCH4 519 aa26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 USP37Q86T82 979 aa26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 MAP4K3Q8IVH8 894 aa26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 PJA1Q8NG27 643 aa26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 MIA3Q5JRA6 1907 aa26.86■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 OAZ2O95190 189 aa26.85■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 ADRB2P07550 413 aa26.85■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 PRSS36Q5K4E3 855 aa26.85■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa26.85■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 DSTYKQ6XUX3 929 aa26.85■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 BEST2Q8NFU1 509 aa26.85■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 FAM212AQ96EL1 285 aa26.85■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 FOXQ1Q9C009 403 aa26.85■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.85■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa26.84■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 MICAL2O94851 1124 aa26.84■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 NMT1P30419 496 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 SLC44A4Q53GD3 710 aa26.84■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa26.84■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 LEMD2Q8NC56 503 aa26.84■■□□□ 1.89
TTC13-208ENST00000522399 EPSTI1Q96J88 318 aa26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms