RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517557.5

PTDSS1-203, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTDSS1, Length 757 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-203ENST00000517557 PRSS36Q5K4E3 855 aa24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 ZNF280DQ6N043 979 aa24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 APPL2Q8NEU8 664 aa24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 FRYLO94915 3013 aa24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 CXCL8P10145 99 aa24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 UBXN2BQ14CS0 331 aa24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 DDX12PQ92771 950 aa24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 TMX3Q96JJ7 454 aa24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 BCO2Q9BYV7 579 aa24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 OSBPL6Q9BZF3 934 aa24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 PCDHB8Q9UN66 801 aa24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-203ENST00000517557 H0YCG3 227 aa24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 H3BQV1 296 aa24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 GJB2P29033 226 aa24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 ARSHQ5FYA8 562 aa24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 TANGO2Q6ICL3 276 aa24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 ELSPBP1Q96BH3 223 aa24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 TCEAL4Q96EI5 215 aa24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 LTB4R2Q9NPC1 389 aa24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 F5P12259 2224 aa24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 FAM170BA6NMN3 283 aa24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 ZNF197O14709 1029 aa24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 CLTAP09496 248 aa24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 CD72P21854 359 aa24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 NCKAP1LP55160 1127 aa24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 SPAG1Q07617 926 aa24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 ADCY1Q08828 1119 aa24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 TMEM130Q8N3G9 435 aa24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 BICD1Q96G01 975 aa24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 MAFFQ9ULX9 164 aa24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 DMXL1Q9Y485 3027 aa24.74■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 TTC26A0AVF1 554 aa24.74■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 MICAL2O94851 1124 aa24.74■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 FCARP24071 287 aa24.74■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 LRPAP1P30533 357 aa24.74■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 CCR2P41597 374 aa24.74■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 TPRG1Q6ZUI0 275 aa24.74■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24.74■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 ELMOD1Q8N336 334 aa24.74■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 KCNN1Q92952 543 aa24.74■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 ANK1P16157 1881 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 M0QZQ0 153 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 SLC26A4O43511 780 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 CPB1P15086 417 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 TNFSF9P41273 254 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 MAGEA9P43362 315 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 FOXK2Q01167 660 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 TWF1Q12792 350 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 ZBTB6Q15916 424 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 FAM78AQ5JUQ0 283 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 CYP4A22Q5TCH4 519 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 IQCEQ6IPM2 695 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 KIF12Q96FN5 646 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 AK8Q96MA6 479 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 CEP72Q9P209 647 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 CYP3A5P20815 502 aa24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 ID4P47928 161 aa24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 LIG4P49917 911 aa24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 PPP2R3AQ06190 1150 aa24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 HS6ST3Q8IZP7 471 aa24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 DNASE1L2Q92874 299 aa24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 NELL2Q99435 816 aa24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 REEP2Q9BRK0 252 aa24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 ZFP14Q9HCL3 533 aa24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 HEBP1Q9NRV9 189 aa24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 FBXO4Q9UKT5 387 aa24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa24.71■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 LACTBL1A8MY62 500 aa24.71■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 LAMTOR5O43504 91 aa24.71■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 OAZ2O95190 189 aa24.71■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 TARSP26639 723 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 GRM2Q14416 872 aa24.71■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 ZNF528Q3MIS6 628 aa24.71■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 ZNF852Q6ZMS4 543 aa24.71■■□□□ 1.55
PTDSS1-203ENST00000517557 GPBP1Q86WP2 473 aa24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms