RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 R4GN57 208 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 CFAP54Q96N23 3096 aa18.44■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 H0YCG3 227 aa18.44■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 ECI2O75521 394 aa18.44■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
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HERC3-211ENST00000513325 TNFSF9P41273 254 aa18.44■□□□□ 0.54
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HERC3-211ENST00000513325 TCEAL4Q96EI5 215 aa18.44■□□□□ 0.54
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HERC3-211ENST00000513325 ODF2LQ9ULJ1 636 aa18.44■□□□□ 0.54
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HERC3-211ENST00000513325 FAM189A1O60320 539 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 OAZ2O95190 189 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 KRT18P05783 430 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 OR4Q2P0C623 313 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 MYL4P12829 197 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 PLCG1P19174 1290 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 ZNF131P52739 623 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 GRM2Q14416 872 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 MCM6Q14566 821 aa18.4■□□□□ 0.54
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