RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPP7	Q9UHL4	492 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSC2	P49815	1807 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANO9	A1A5B4	782 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR27	A2RRH5	827 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM221	A6NGB7	291 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014		M0QZQ0	153 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014		M0R296	226 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPTLC1	O15269	473 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABLIM3	O94929	683 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	GCNT3	O95395	438 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	IDE	P14735	1019 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	HOXA9	P31269	272 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	EHHADH	Q08426	723 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	DHX58	Q96C10	678 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	DMD	P11532	3685 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIR	O00625	290 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCL16	O15467	120 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	VNN2	O95498	520 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	POU2F2	P09086	479 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	CASP1	P29466	404 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	MCM4	P33991	863 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	NTHL1	P78549	312 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	POTEH	Q6S545	545 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD302	Q8IX05	232 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM212A	Q96EL1	285 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACCS	Q96QU6	501 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	DERA	Q9Y315	318 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCHH	Q07283	1943 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEC24A	O95486	1093 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	ME1	P48163	572 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	LILRA4	P59901	499 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALCAM	Q13740	583 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASB7	Q9H672	318 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	C2CD2	Q9Y426	696 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	OAZ2	O95190	189 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	GART	P22102	1010 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	POSTN	Q15063	836 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	RTL10	Q7L3V2	364 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	APPL2	Q8NEU8	664 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	CXorf38	Q8TB03	319 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	BORCS6	Q96GS4	357 aa		13.78	□□□□□ -0.2

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