RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 KLRC4O43908 158 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP3A5P20815 502 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 CMA1P23946 247 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1D2P34982 312 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFA8P51970 172 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 AMPD3Q01432 767 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA1Q5VX52 437 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 PAGE5Q96GU1 130 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 NECTIN4Q96NY8 510 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 OBSL1O75147 1896 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SPTLC1O15269 473 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 DCXO43602 365 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAPPC3O43617 180 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SLFN14P0C7P3 912 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 ROR1Q01973 937 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR27A2RRH5 827 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SYN3O14994 580 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D4O60343 1298 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 C8AP07357 584 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 GARTP22102 1010 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 PDXDC1Q6P996 788 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 FSIP1Q8NA03 581 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 BEST2Q8NFU1 509 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM206Q9H813 350 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 C2CD2Q9Y426 696 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 CLUHO75153 1309 aa20.27■□□□□ 0.84
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SH3BP2-218ENST00000511185 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 TGFB1I1O43294 461 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 ZMYND10O75800 440 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 PAPLNO95428 1278 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB33AQ14088 237 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 POSTNQ15063 836 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 CD302Q8IX05 232 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 ASB7Q9H672 318 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 DERAQ9Y315 318 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPRDP23468 1912 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE4BO95155 1302 aa20.27■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 ANO9A1A5B4 782 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 PIRO00625 290 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 CCL16O15467 120 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 SYKP43405 635 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 ARPP19P56211 112 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 LIN9Q5TKA1 542 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF280DQ6N043 979 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 GPD1LQ8N335 351 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PQ27 194 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PQ64 194 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PQD8 194 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 EXTL3O43909 919 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 IL18RAPO95256 599 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 ASGR2P07307 311 aa20.25■□□□□ 0.83
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