RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 SLC35A4Q96G79 324 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 SLC2A13Q96QE2 648 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 PDCD2LQ9BRP1 358 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM54Q9BYV2 358 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 BCO1Q9HAY6 547 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 SAYSD1Q9NPB0 183 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 TDP1Q9NUW8 608 aa2.6□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 MYBP10242 640 aa2.6□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 KRT28Q7Z3Y7 464 aa2.6□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 FAM126BQ8IXS8 530 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC33Q8N5R6 958 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 PPM1NQ8N819 430 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 PDZD8Q8NEN9 1154 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 OR6B3Q8NGW1 331 aa2.6□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 MRGPRX1Q96LB2 322 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 C7orf26Q96N11 449 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 WRNIP1Q96S55 665 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 APOL5Q9BWW9 433 aa2.6□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 OR10A5Q9H207 317 aa2.59□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP2.59□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 KIF17Q9P2E2 1029 aa2.59□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 CTNND2Q9UQB3 1225 aa2.59□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa2.59□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PLA2R1Q13018 1463 aa2.59□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF839A8K0R7 811 aa2.59□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NFIBO00712 420 aa2.59□□□□□ -2
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