RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMD2Q13200 908 aa22.86■■□□□ 1.25
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SH3BP2-210ENST00000505941 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-210ENST00000505941 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR149Q86SP6 731 aa22.86■■□□□ 1.25
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SH3BP2-210ENST00000505941 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.83■■□□□ 1.25
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SH3BP2-210ENST00000505941 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.83■■□□□ 1.25
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SH3BP2-210ENST00000505941 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.82■■□□□ 1.24
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SH3BP2-210ENST00000505941 ZMYND10O75800 440 aa22.81■■□□□ 1.24
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SH3BP2-210ENST00000505941 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-210ENST00000505941 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-210ENST00000505941 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-210ENST00000505941 LILRA4P59901 499 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-210ENST00000505941 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-210ENST00000505941 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-210ENST00000505941 METTL23Q86XA0 190 aa22.8■■□□□ 1.24
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