RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 DACT2Q5SW24 774 aa5.91□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 LRCH2Q5VUJ6 765 aa5.91□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 COLGALT2Q8IYK4 626 aa5.91□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 ATL2Q8NHH9 583 aa5.91□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 ZNF384Q8TF68 577 aa5.91□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 KLK15Q9H2R5 256 aa5.91□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa5.91□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.9□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 SBK3P0C264 359 aa5.9□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 CTXN1P60606 82 aa5.9□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 CREMQ03060 361 aa5.9□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 MED15Q96RN5 788 aa5.9□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 IL17RBQ9NRM6 502 aa5.9□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.9□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 DMTF1Q9Y222 760 aa5.9□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 PHLDB1Q86UU1 1377 aa5.9□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 TRIM75PA6NK02 468 aa5.89□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 HAUS5O94927 633 aa5.89□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 CDK4P11802 303 aa5.89□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 CLUL1Q15846 466 aa5.89□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 AMOTL1Q8IY63 956 aa5.89□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 TMEM125Q96AQ2 219 aa5.89□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 TMX3Q96JJ7 454 aa5.89□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 ASB6Q9NWX5 421 aa5.89□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.89□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 GRM6O15303 877 aa5.88□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 AGFG2O95081 481 aa5.88□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 IARSP41252 1262 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 WASP42768 502 aa5.88□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 NHLH1Q02575 133 aa5.88□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 CNTD1Q8N815 330 aa5.88□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 CDYLQ9Y232 598 aa5.88□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 KAT6AQ92794 2004 aa5.87□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 PEX1O43933 1283 aa5.87□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 FOLR3P41439 243 aa5.87□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 INAVAQ3KP66 663 aa5.87□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.87□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 IFI44Q8TCB0 444 aa5.87□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 JADE3Q92613 823 aa5.87□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 WDR26Q9H7D7 661 aa5.87□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa5.87□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 SLC17A6Q9P2U8 582 aa5.87□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 A0A1W2PS29 197 aa5.86□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 YY2O15391 372 aa5.86□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 NDUFS2O75306 463 aa5.86□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 C5AR1P21730 350 aa5.86□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 GATA3P23771 443 aa5.86□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 KIAA0895LQ68EN5 471 aa5.86□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 VWA1Q6PCB0 445 aa5.86□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa5.86□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 RSPH3Q86UC2 560 aa5.86□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.86□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 LPIN2Q92539 896 aa5.86□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 KLHL32Q96NJ5 620 aa5.86□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 TDP1Q9NUW8 608 aa5.86□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.86□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 PRAMEF10O60809 474 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 MT-CO1P00395 513 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 KCNA2P16389 499 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 MAPK10P53779 464 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 PROK1P58294 105 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 CDC42EP1Q00587 391 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 FOXF2Q12947 444 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 IL10RAQ13651 578 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 ATP2B3Q16720 1220 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 PGM2L1Q6PCE3 622 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 MIGA2Q7L4E1 593 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 TFAP2BQ92481 460 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 HEPHQ9BQS7 1158 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 SLC5A4Q9NY91 659 aa5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 CLSTN1O94985 981 aa5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 ELFN1P0C7U0 828 aa5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 SRGNP10124 158 aa5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 EDNRBP24530 442 aa5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 MC2RQ01718 297 aa5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.84□□□□□ -1.47
SSB-211ENST00000490914 AKNAD1Q5T1N1 836 aa5.84□□□□□ -1.47
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