RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 AAASQ9NRG9 546 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 CDH23Q9H251 3354 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 CARNS1A5YM72 827 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 SMTNL1A8MU46 457 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 ATP1A3P13637 1013 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 PPM1AP35813 382 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.046e-51■□□□□ 10.8
ACTB-210ENST00000477812 MIIPQ5JXC2 388 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 TCERG1LQ5VWI1 586 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 SPG21Q9NZD8 308 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.044e-16■□□□□ 9.9
ACTB-210ENST00000477812 SCN1AP35498 2009 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 SPTLC1O15269 473 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 PMM2O15305 246 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 STX10O60499 249 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 B3GAT3O94766 335 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 RB1P06400 928 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 MXI1P50539 228 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 PLCB3Q01970 1234 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 KRT31Q15323 416 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 MAN2A1Q16706 1144 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 LRRC52Q8N7C0 313 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 EPOPA6NHQ4 379 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 BECN2A8MW95 431 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 FGF18O76093 207 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 FMO5P49326 533 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 RBP5P82980 135 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 KCNH2Q12809 1159 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 KRT39Q6A163 491 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 HASPINQ8TF76 798 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 LRCH3Q96II8 777 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 HLA-DRAP01903 254 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 LILRA4P59901 499 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 BIRC3Q13489 604 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 NCOA4Q13772 614 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 SEMA4DQ92854 862 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 ZNF576Q9H609 170 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 H3BNC9 293 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 LRRN2O75325 713 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 KRT19P08727 400 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 PNPLA4P41247 253 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 MYL6P60660 151 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 MYL7Q01449 175 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 VWA3BQ502W6 1294 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 FUT10Q6P4F1 479 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 ZNF560Q96MR9 790 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 CERS4Q9HA82 394 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 TAB2Q9NYJ8 693 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 TRANK1O15050 2925 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 P4HA2O15460 535 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 BRCC3P46736 316 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 TAF6P49848 677 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 RNF214Q8ND24 703 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 LMO3Q8TAP4 145 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 SPPL3Q8TCT6 385 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 TMEM169Q96HH4 297 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 HPDLQ96IR7 371 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 SUSD3Q96L08 255 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 NDST4Q9H3R1 872 aa21.47■■□□□ 1.03
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