RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 LRWD1Q9UFC0 647 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 CCDC169A6NNP5 214 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 LAMTOR5O43504 91 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 HARSP12081 509 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PTPN2P17706 415 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 MUTP22033 750 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 CDR1P51861 262 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 EFNA5P52803 228 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 EPHA5P54756 1037 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ADCY1Q08828 1119 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PPP2R5AQ15172 486 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TEAD2Q15562 447 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ZBTB6Q15916 424 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ZNF568Q3ZCX4 644 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PDXDC1Q6P996 788 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TMC8Q8IU68 726 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TTC9BQ8N6N2 239 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 BEST2Q8NFU1 509 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 IFT74Q96LB3 600 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 UROC1Q96N76 676 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TBC1D32Q96NH3 1257 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TMEM209Q96SK2 561 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 EPC1Q9H2F5 836 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ZSCAN32Q9NX65 697 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SYN3O14994 580 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 FAM189A1O60320 539 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 KINO60870 393 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 CXCL8P10145 99 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 MCF2P10911 925 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 CHRNB1P11230 501 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TNFSF9P41273 254 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 RPS9P46781 194 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SOX9P48436 509 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PFKPQ01813 784 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TWF1Q12792 350 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TRIM29Q14134 588 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 LPAL2Q16609 132 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 CTXN3Q4LDR2 81 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ARSHQ5FYA8 562 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SCARA3Q6AZY7 606 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TXNDC11Q6PKC3 985 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 MPZL3Q6UWV2 235 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 RTL10Q7L3V2 364 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ERMNQ8TAM6 284 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ACAP3Q96P50 834 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 CHRDQ9H2X0 955 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa11.87□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SPTLC1O15269 473 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SOAT2O75908 522 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 GDI1P31150 447 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TRAPPC10P48553 1259 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SATB1Q01826 763 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PDIA5Q14554 519 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 DNASE1L2Q92874 299 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PGLYRP2Q96PD5 576 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PLIN2Q99541 437 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 HINFPQ9BQA5 517 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 IKZF4Q9H2S9 585 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 LMAN1LQ9HAT1 526 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 KMT5AQ9NQR1 393 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 YIPF1Q9Y548 306 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SDK1Q7Z5N4 2213 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TTC26A0AVF1 554 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 DCDC2BA2VCK2 349 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 HEPACAM2A8MVW5 462 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 M0QZQ0 153 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PRRG1O14668 218 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 HRO43593 1189 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TRAPPC3O43617 180 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 KRT37O76014 449 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 MICAL2O94851 1124 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 LRG1P02750 347 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 MYL4P12829 197 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 LRPAP1P30533 357 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms