RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468069.1

RPS6KC1-203, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KC1, Length 784 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-203ENST00000468069 MYH1P12882 1939 aa6.7□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 SMIM22K7EJ46 135 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC25A27O95847 323 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 ASGR1P07306 291 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 TRIM27P14373 513 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 INSRRP14616 1297 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 STAT3P40763 770 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 CCL23P55773 120 aa6.7□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 CR1LQ2VPA4 569 aa6.7□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 STEAP3Q658P3 488 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.7□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 TMEM199Q8N511 208 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 NRBP1Q9UHY1 535 aa6.7□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 ADCY6O43306 1168 aa6.69□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 DGKIO75912 1065 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 PLATP00750 562 aa6.69□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 PRR31Q5SQ13 230 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 KRT40Q6A162 431 aa6.69□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 ARHGAP45Q92619 1136 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 ARMT1Q9H993 441 aa6.69□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 DTLQ9NZJ0 730 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 INVSQ9Y283 1065 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.69□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 A0A0G2JMZ2 1700 aa6.68□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 CYP7B1O75881 506 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 GJB6O95452 261 aa6.68□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 ATP8B2P98198 1209 aa6.68□□□□□ -1.34
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RPS6KC1-203ENST00000468069 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 EMC4Q5J8M3 183 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 CPXCR1Q8N123 301 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 SSH3Q8TE77 659 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS6KC1-203ENST00000468069 HERVK_113Q902F9 699 aa6.68□□□□□ -1.34
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