RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR149Q86SP6 731 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 CABP7Q86V35 215 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM130Q8N3G9 435 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 KCT2Q8NC54 265 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM13CQ8NE31 585 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 DNERQ8NFT8 737 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 PPTC7Q8NI37 304 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF507Q8TCN5 953 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 STAMQ92783 540 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SGSM3Q96HU1 749 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 RUSC1Q9BVN2 902 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 FTHL17Q9BXU8 183 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 KLHL3Q9UH77 587 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 WDR81Q562E7 1941 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 KNTC1P50748 2209 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 FREM2Q5SZK8 3169 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPRCP08575 1304 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 NRCAMQ92823 1304 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 ATG2BQ96BY7 2078 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 C2orf71A6NGG8 1288 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 NFIBO00712 420 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 PPFIA4O75335 1185 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 CST3P01034 146 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 PRB1P04280 392 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 ICAM1P05362 532 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF806P0C7X5 589 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SCG2P13521 617 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 AMPD1P23109 780 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 HOXC8P31273 242 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 PPM1AP35813 382 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 GMPRP36959 345 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS9P46781 194 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 GATMP50440 423 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 RAC1P63000 192 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC7A5Q01650 507 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 PRKCQQ04759 706 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 TROAPQ12815 778 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 LPIN1Q14693 890 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 C12orf60Q5U649 245 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SLFN13Q68D06 897 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF43Q68DV7 783 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA1211LQ6NV74 962 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC30A10Q6XR72 485 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF207Q6ZRF8 634 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SEPT14Q6ZU15 432 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 UBE3DQ7Z6J8 389 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 PPFIBP1Q86W92 1011 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 STAG1Q8WVM7 1258 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 GLG1Q92896 1179 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 LRIG1Q96JA1 1093 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 DHRS1Q96LJ7 313 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 NELL2Q99435 816 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SPATA9Q9BWV2 254 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 CLMPQ9H6B4 373 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 CYP4F12Q9HCS2 524 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 LTB4R2Q9NPC1 389 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SMC4Q9NTJ3 1288 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 CLIP2Q9UDT6 1046 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDHB10Q9UN67 800 aa4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPRBP23467 1997 aa4.67□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 THADAQ6YHU6 1953 aa4.67□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 LAMA5O15230 3695 aa4.67□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRK2Q5S007 2527 aa4.67□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa4.67□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 TBKBP1A7MCY6 615 aa4.67□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SRGAP3O43295 1099 aa4.67□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 PLA2G6O60733 806 aa4.67□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 C1QL1O75973 258 aa4.67□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 KRT38O76015 456 aa4.67□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 CHRNA1P02708 482 aa4.67□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 CEACAM1P13688 526 aa4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms