RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454225.1

CITED1-210, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene CITED1, Length 716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-210ENST00000454225 PTPN21Q16825 1174 aa28.06■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 TSPAN18Q96SJ8 248 aa28.06■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 PRKD2Q9BZL6 878 aa28.06■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa28.06■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 ANK1P16157 1881 aa28.06■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 CLUHO75153 1309 aa28.05■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 TMEM132DQ14C87 1099 aa28.05■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 PPM1LQ5SGD2 360 aa28.05■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 SPATA1Q5VX52 437 aa28.05■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 OTOP3Q7RTS5 596 aa28.05■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa28.05■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 BEST2Q8NFU1 509 aa28.05■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 MAGEF1Q9HAY2 307 aa28.05■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 PAPLNO95428 1278 aa28.04■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 PLCD3Q8N3E9 789 aa28.04■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 GLIS3Q8NEA6 775 aa28.04■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 SLC7A14Q8TBB6 771 aa28.04■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 LIMD1Q9UGP4 676 aa28.04■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 DOCK6Q96HP0 2047 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 H7C4K7 107 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 PPEF2O14830 753 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 ASGR2P07307 311 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 ARPP19P56211 112 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 KRT85P78386 507 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 ROR1Q01973 937 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 APPL2Q8NEU8 664 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 SAAL1Q96ER3 474 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 C7orf25Q9BPX7 421 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 FAM213AQ9BRX8 229 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 ASB7Q9H672 318 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 KCNH3Q9ULD8 1083 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 PCDHB8Q9UN66 801 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 DERAQ9Y315 318 aa28.03■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 CASP1P29466 404 aa28.02■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 CTXN3Q4LDR2 81 aa28.02■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 SLC8B1Q6J4K2 584 aa28.02■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 CNNM4Q6P4Q7 775 aa28.02■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 TRIM67Q6ZTA4 783 aa28.02■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa28.02■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa28.02■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 SPATA32Q96LK8 384 aa28.02■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 BLZF1Q9H2G9 400 aa28.02■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 TMEM206Q9H813 350 aa28.02■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 FBXL5Q9UKA1 691 aa28.02■■■□□ 2.08
CITED1-210ENST00000454225 CCL16O15467 120 aa28.01■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 TBC1D4O60343 1298 aa28.01■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP28.01■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 BECN1Q14457 450 aa28.01■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 C9orf57Q5W0N0 161 aa28.01■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 ZNF280DQ6N043 979 aa28.01■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 CBWD1Q9BRT8 395 aa28.01■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 POLIQ9UNA4 740 aa28.01■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 C2CD2Q9Y426 696 aa28.01■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 WDR27A2RRH5 827 aa28■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 M0QZQ0 153 aa28■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 GARTP22102 1010 aa28■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 HOXA9P31269 272 aa28■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 AFMP43652 599 aa28■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP28■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 FAM26FQ5R3K3 315 aa28■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 DSTYKQ6XUX3 929 aa28■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 SORCS3Q9UPU3 1222 aa28■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 GOLGA8IPA6NC78 632 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 TMEM221A6NGB7 291 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 GOLGA8JA6NMD2 632 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 M0R296 226 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 IL18RAPO95256 599 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 UVSSAQ2YD98 709 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 ARMCX5Q6P1M9 558 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 HFE2Q6ZVN8 426 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 UNC13DQ70J99 1090 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 EFCAB13Q8IY85 973 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 CEP57L1Q8IYX8 460 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 ZNF461Q8TAF7 563 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 MYADMQ96S97 322 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 PCIF1Q9H4Z3 704 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 SERTAD1Q9UHV2 236 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 DOCK8Q8NF50 2099 aa27.99■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 TCHHQ07283 1943 aa27.98■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 XYLBO75191 536 aa27.98■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 WNT7BP56706 349 aa27.98■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 NTHL1P78549 312 aa27.98■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CITED1-210ENST00000454225 SIGLEC14Q08ET2 396 aa27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms