RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 RARAP10276 462 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 GPC3P51654 580 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 TMED2Q15363 201 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 KIZQ2M2Z5 673 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 LCA5LO95447 670 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 CUL1Q13616 776 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC39A4Q6P5W5 647 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 ISCUQ9H1K1 167 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 HES2Q9Y543 173 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A087WZ62 844 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 CUL2Q13617 745 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 RFX6Q8HWS3 928 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 NETO2Q8NC67 525 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 ERP44Q9BS26 406 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 PDGFRBP09619 1106 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 RASGRF2O14827 1237 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 ITGB3P05106 788 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 BASP1P80723 227 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 MTMR3Q13615 1198 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 CAPSQ13938 189 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC89Q8N998 374 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 CDCA5Q96FF9 252 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 DMAC2Q9NW81 257 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 TTLL3Q9Y4R7 772 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-210ENST00000437078 M0QYV0 167 aa14.4□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 ETS1P14921 441 aa14.4□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.4□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.4□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.4□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 AFG1LQ8WV93 481 aa14.4□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.4□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 SPAG7O75391 227 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 OSBPP22059 807 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF516Q92618 1163 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 CHRNB2P17787 502 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 BPIFB4P59827 614 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 PORCNQ9H237 461 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 PFASO15067 1338 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 H0YCG3 227 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 PPFIA4O75335 1185 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 PTPRJQ12913 1337 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 F8VP50 259 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 GOLGA8RI6L899 631 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 ARIH2O95376 493 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 GPS1Q13098 491 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 BBS9Q3SYG4 887 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM192Q8IY95 271 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-210ENST00000437078 ADCYAP1R1P41586 468 aa14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms