RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 NBPF20Q3BBV1 942 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 RNF135Q8IUD6 432 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 FAM151AQ8WW52 585 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 FOPNLQ96NB1 174 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 KBTBD13C9JR72 458 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 TLR2O60603 784 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 JCADQ9P266 1359 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PSMD14O00487 310 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 STK25O00506 426 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 GAS2O43903 313 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 GFAPP14136 432 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PDK1Q15118 436 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ANKMY2Q8IV38 441 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 STX19Q8N4C7 294 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 STKLD1Q8NE28 680 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 RAET1EQ8TD07 263 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa13.76□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CAMTA2O94983 1202 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP13.75□□□□□ -0.215e-10■■■■■ 124.2
TNS1-207ENST00000430930 CPA5Q8WXQ8 436 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 MCEEQ96PE7 176 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PRR12Q9ULL5 1215 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 TADA2AO75478 443 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ATXN8OSP0DMR3 200 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PDHBP11177 359 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 STYK1Q6J9G0 422 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP13.75□□□□□ -0.215e-7■■■■□ 23.6
TNS1-207ENST00000430930 C17orf75Q9HAS0 396 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 NEU2Q9Y3R4 380 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SNX9Q9Y5X1 595 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ST8SIA6P61647 398 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PPP2R3CQ969Q6 453 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 NT5C1AQ9BXI3 368 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 MYMKA6NI61 221 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 GOLGA8TH3BQL2 631 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ZBTB7AO95365 584 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 MYBP10242 640 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PGM1P36871 562 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PNPLA4P41247 253 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 RAD23BP54727 409 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CCZ1BP86790 482 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 VPS72Q15906 364 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 TMEM143Q96AN5 459 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 WDR24Q96S15 920 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 OLFML3Q9NRN5 406 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PPP1R37O75864 691 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 NR3C2P08235 984 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 MUTP22033 750 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ATF7IP2Q5U623 682 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 POTEAQ6S8J7 498 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 RRM2BQ7LG56 351 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CEP70Q8NHQ1 597 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SCFD2Q8WU76 684 aa13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 TCP11X1B4DZS4 312 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 RPS12P25398 132 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PRKCEQ02156 737 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 STX3Q13277 289 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 EFHC1Q5JVL4 640 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ZNF555Q8NEP9 628 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 DPF2Q92785 391 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ELMO2Q96JJ3 720 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 RRN3P2A6NIE6 340 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 MAN1A2O60476 641 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 KLHL2O95198 593 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 GPD1P21695 349 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 RPA1P27694 616 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PCSK1P29120 753 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PTPRN2Q92932 1015 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CYP4F11Q9HBI6 524 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CD163L1Q9NR16 1453 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms