RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429285.6

NCOR2-208, Transcript of nuclear receptor corepressor 2, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCOR2, Length 8,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCOR2-208	ENST00000429285	TINF2	Q9BSI4	451 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	KCTD1	Q719H9	257 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	HES6	Q96HZ4	224 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	TEX28	O15482	410 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	CHN1	P15882	459 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	KCNK10	P57789	538 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	ACTR2	P61160	394 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	STX5	Q13190	355 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	MTERF2	Q49AM1	385 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	SPATA2	Q9UM82	520 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	REST	Q13127	1097 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	GTF2H3	Q13889	308 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	PHKA2	P46019	1235 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	MTFR1	Q15390	333 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	AGR3	Q8TD06	166 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	SNPH	O15079	494 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	BMP3	P12645	472 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	OSTN	P61366	133 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF235	Q14590	738 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	URGCP	Q8TCY9	931 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC20A2	Q08357	652 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	COX10	Q12887	443 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	KRT73	Q86Y46	540 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CEP44	Q9C0F1	390 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	FKBP6	O75344	327 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285		Q3C1V9	767 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	SYTL3	Q4VX76	610 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF544	Q6NX49	715 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CAND2	O75155	1236 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	RRM2	P31350	389 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	COPA	P53621	1224 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ANO4	Q32M45	955 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	GPC3	P51654	580 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CFAP99	D6REC4	459 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	RTN2	O75298	545 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	FGFR4	P22455	802 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	MMRN1	Q13201	1228 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CHD4	Q14839	1912 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	KRT76	Q01546	638 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	MAPK6	Q16659	721 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ITGAX	P20702	1163 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM160B2	Q86V87	743 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	KYNU	Q16719	465 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	TSC22D2	O75157	780 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	RGS4	P49798	205 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		13.94	□□□□□ -0.18

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