RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TBX20Q9UMR3 447 aa22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 M0QZQ0 153 aa22.86■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 STK25O00506 426 aa22.86■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 PRRG1O14668 218 aa22.86■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 PTPN2P17706 415 aa22.86■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.251e-8■■■□□ 14.8
LIMS1-208ENST00000428064 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 LIG4P49917 911 aa22.86■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 GPC5P78333 572 aa22.86■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.86■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.86■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.86■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.86■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.86■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 K7ENM7 598 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 OGTO15294 1046 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 TRAK2O60296 914 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 ECI2O75521 394 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 FAM13AO94988 1023 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 PLCG1P19174 1290 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 PFKPQ01813 784 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 PRKCQQ04759 706 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 GRIN1Q05586 938 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 MYCT1Q8N699 235 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 PJA1Q8NG27 643 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 FIZ1Q96SL8 496 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 OAZ2O95190 189 aa22.84■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 SEC24AO95486 1093 aa22.84■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 TNFSF9P41273 254 aa22.84■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 GTF2BQ00403 316 aa22.84■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.84■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.84■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 CD302Q8IX05 232 aa22.84■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 BEST2Q8NFU1 509 aa22.84■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 KIF12Q96FN5 646 aa22.84■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.84■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0B4J269 797 aa22.83■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 PDCP20941 246 aa22.83■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 PAX3P23760 479 aa22.83■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 ARPP19P56211 112 aa22.83■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 MCM6Q14566 821 aa22.83■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 ING5Q8WYH8 240 aa22.83■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 KXD1Q9BQD3 176 aa22.83■■□□□ 1.25
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF197O14709 1029 aa22.82■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 ELMOD1Q8N336 334 aa22.82■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 LEMD2Q8NC56 503 aa22.82■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.82■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.82■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22.82■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.82■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 LACTBL1A8MY62 500 aa22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 DCNP07585 359 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 CPB1P15086 417 aa22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 CEBPBP17676 345 aa22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 DDIT3P35638 169 aa22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 EPHA5P54756 1037 aa22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 SPAG1Q07617 926 aa22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 ADCY1Q08828 1119 aa22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA1Q5VX52 437 aa22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 CORO1BQ9BR76 489 aa22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 DERAQ9Y315 318 aa22.81■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 TSC2P49815 1807 aa22.8■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 TYMPP19971 482 aa22.8■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 PTPAQ15257 358 aa22.8■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.8■■□□□ 1.24
LIMS1-208ENST00000428064 IQCEQ6IPM2 695 aa22.8■■□□□ 1.24
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