RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 SATB1Q01826 763 aa15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 DMWDQ09019 674 aa15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 SPEM2Q0P670 501 aa15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 PPP2R5AQ15172 486 aa15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 DAW1Q8N136 415 aa15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 TMEM130Q8N3G9 435 aa15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 C4orf32Q8N8J7 132 aa15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 FAM3CQ92520 227 aa15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 SMARCD2Q92925 531 aa15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 LRRC3Q9BY71 257 aa15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 K7ERI5 159 aa15.61■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 ZNF197O14709 1029 aa15.61■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 ADRB1P08588 477 aa15.61■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 PSMC3P17980 439 aa15.61■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 OSTNP61366 133 aa15.61■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 ZNF174Q15697 407 aa15.61■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 TPGS2Q68CL5 300 aa15.61■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 KIFAP3Q92845 792 aa15.61■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 IRF7Q92985 503 aa15.61■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 SUSD3Q96L08 255 aa15.61■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 BHMT2Q9H2M3 363 aa15.61■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 C2orf42Q9NWW7 574 aa15.61■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15.61■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 K7ESF4 209 aa15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 SLC30A4O14863 429 aa15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 RETP07949 1114 aa15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 MUTP22033 750 aa15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 NPTX2P47972 431 aa15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 NRLP54845 237 aa15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 ANKRD1Q15327 319 aa15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 LAIR1Q6GTX8 287 aa15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 MFSD6LQ8IWD5 586 aa15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 IFT74Q96LB3 600 aa15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 LRRC3BQ96PB8 259 aa15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 CNTN3Q9P232 1028 aa15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.6■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 H7C4K7 107 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 OR52Z1P0C646 297 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 CCNE1P24864 410 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 RPL9P32969 192 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 CXCL12P48061 93 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 ANAPC15P60006 121 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 GUCY1B3Q02153 619 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 TWF1Q12792 350 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 MAPK7Q13164 816 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 CTXN3Q4LDR2 81 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 CYP4A22Q5TCH4 519 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 BEST2Q8NFU1 509 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 ERMNQ8TAM6 284 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 SHKBP1Q8TBC3 707 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 IER2Q9BTL4 223 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 CRISPLD1Q9H336 500 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 TMEM134Q9H6X4 195 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 SLC38A7Q9NVC3 462 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 KIAA1024Q9UPX6 916 aa15.59■□□□□ 0.09
NFE4-201ENST00000420058 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 GDF9O60383 454 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 LRP3O75074 770 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 MCF2P10911 925 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 MYL4P12829 197 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 FNTBP49356 437 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 CCR3P51677 355 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 YARSP54577 528 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 PEX3P56589 373 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 PTGDRQ13258 359 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 TEAD2Q15562 447 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 TXNDC11Q6PKC3 985 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 TMC8Q8IU68 726 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 SPEM1Q8N4L4 309 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 DDX12PQ92771 950 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 TBC1D32Q96NH3 1257 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 ACAP3Q96P50 834 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 MKNK1Q9BUB5 465 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 DNAJC25Q9H1X3 360 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 SEMA4GQ9NTN9 838 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 MAFFQ9ULX9 164 aa15.58■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa15.57■□□□□ 0.08
NFE4-201ENST00000420058 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms