RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383331.4

HCG27-201, Transcript of HLA complex group 27, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HCG27, Length 1,720 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG27-201ENST00000383331 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 MMEP08473 750 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 RHOXF2BP0C7M4 288 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ACO1P21399 889 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ABCB4P21439 1286 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 RPS6KA1Q15418 735 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ZNF568Q3ZCX4 644 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TAF3Q5VWG9 929 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 SPOPLQ6IQ16 392 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 MMGT1Q8N4V1 131 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 SPATA4Q8NEY3 305 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 SCLT1Q96NL6 688 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ARID3AQ99856 593 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 RHOXF2Q9BQY4 288 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CDT1Q9H211 546 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 OSGEPQ9NPF4 335 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 MYADML2A6NDP7 307 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CLTAP09496 248 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 KRT5P13647 590 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PAFAH1B1P43034 410 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TRIM32Q13049 653 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CUL2Q13617 745 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 NCOA4Q13772 614 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TMEM132AQ24JP5 1023 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CFAP221Q4G0U5 840 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CCDC181Q5TID7 509 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TAF2Q6P1X5 1199 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 NT5DC3Q86UY8 548 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 RHOT2Q8IXI1 618 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 KLHDC9Q8NEP7 349 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ADAMTS10Q9H324 1103 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 GOLPH3Q9H4A6 298 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CNTN6Q9UQ52 1028 aa15.98■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 B4GALT4O60513 344 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PHACTR2O75167 634 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 GPR32O75388 356 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ERLIN2O94905 339 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PGK1P00558 417 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ASS1P00966 412 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 MCF2P10911 925 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 BPIFB4P59827 614 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 NOP14P78316 857 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 GPC5P78333 572 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 C2orf54Q08AI8 447 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 DUOXA2Q1HG44 320 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 WDR93Q6P2C0 686 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ZNF677Q86XU0 584 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 DEFB118Q96PH6 123 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 COG5Q9UP83 839 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 NUB1Q9Y5A7 615 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CEP290O15078 2479 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 MTA2O94776 668 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 SMYD5Q6GMV2 418 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PEX26Q7Z412 305 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 DAAM2Q86T65 1068 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 SESTD1Q86VW0 696 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 THNSL1Q8IYQ7 743 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TAF4BQ92750 862 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 DPF3Q92784 378 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 HES6Q96HZ4 224 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 MS4A14Q96JA4 679 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PBKQ96KB5 322 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 EHD2Q9NZN4 543 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.97■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TREHO43280 583 aa15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 IL18RAPO95256 599 aa15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CST3P01034 146 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 VSNL1P62760 191 aa15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 HIC1Q14526 733 aa15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 SCARA3Q6AZY7 606 aa15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 EFCAB13Q8IY85 973 aa15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 UBR7Q8N806 425 aa15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CEP120Q8N960 986 aa15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ARFGAP3Q9NP61 516 aa15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 FAM53CQ9NYF3 392 aa15.96■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 UMODL1Q5DID0 1318 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms