RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 SUSD3Q96L08 255 aa29.26■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 MAN1C1Q9NR34 630 aa29.26■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 DERAQ9Y315 318 aa29.26■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 C2CD2Q9Y426 696 aa29.26■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 TGM5O43548 720 aa29.25■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 XPOTO43592 962 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 TRAPPC3O43617 180 aa29.25■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 LDHAP00338 332 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 GLUD1P00367 558 aa29.25■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 TSPAN18Q96SJ8 248 aa29.25■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 PDE11AQ9HCR9 933 aa29.25■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 DZANK1Q9NVP4 752 aa29.25■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 MTRRQ9UBK8 725 aa29.25■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 SPTLC1O15269 473 aa29.24■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 IL18RAPO95256 599 aa29.24■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP29.24■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 CYP2J2P51589 502 aa29.24■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 ZP2Q05996 745 aa29.24■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 FAM160A1Q05DH4 1040 aa29.24■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 PNOCQ13519 176 aa29.24■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 C9orf57Q5W0N0 161 aa29.24■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 LILRA6Q6PI73 481 aa29.24■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 TMC5Q6UXY8 1006 aa29.24■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 ANO9A1A5B4 782 aa29.23■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 RHOBTB3O94955 611 aa29.23■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 CREMQ03060 361 aa29.23■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 PSMD2Q13200 908 aa29.23■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 FAM50BQ9Y247 325 aa29.23■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 VWA8A3KMH1 1905 aa29.23■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 PTPRJQ12913 1337 aa29.22■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 SYN3O14994 580 aa29.22■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 ADAM7Q9H2U9 754 aa29.22■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 KCTD10Q9H3F6 313 aa29.22■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 SFXN1Q9H9B4 322 aa29.22■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 DPP3Q9NY33 737 aa29.22■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 CDY1Q9Y6F8 540 aa29.22■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 PIRO00625 290 aa29.21■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 RFPL2O75678 378 aa29.21■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 OR1D2P34982 312 aa29.21■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 ANKS3Q6ZW76 656 aa29.21■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 HS2ST1Q7LGA3 356 aa29.21■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 ADHFE1Q8IWW8 467 aa29.21■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 RDH13Q8NBN7 331 aa29.21■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHB8Q9UN66 801 aa29.21■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 BACE2Q9Y5Z0 518 aa29.21■■■□□ 2.27
TPGS1-201ENST00000359315 M0QZQ0 153 aa29.2■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 PDXDC1Q6P996 788 aa29.2■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf127Q8N9H9 656 aa29.2■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 POMKQ9H5K3 350 aa29.2■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa29.2■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 ANK1P16157 1881 aa29.19■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 PLXNA3P51805 1871 aa29.19■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF233A6NK53 670 aa29.19■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 SPDYE4A6NLX3 237 aa29.19■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D4O60343 1298 aa29.19■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 LILRA4P59901 499 aa29.19■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 KCNB1Q14721 858 aa29.19■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 C12orf56Q8IXR9 622 aa29.19■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 KREMEN2Q8NCW0 462 aa29.19■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 OR5B17Q8NGF7 314 aa29.19■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 CXorf38Q8TB03 319 aa29.19■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP29.19■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 MTMR12Q9C0I1 747 aa29.19■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 FBXW11Q9UKB1 542 aa29.19■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 TNFRSF10AO00220 468 aa29.18■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
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TPGS1-201ENST00000359315 RAB33AQ14088 237 aa29.18■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 DSTYKQ6XUX3 929 aa29.18■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 NT5DC4Q86YG4 428 aa29.18■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 GJD3Q8N144 294 aa29.18■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 XXYLT1Q8NBI6 393 aa29.18■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 PRKAG3Q9UGI9 489 aa29.18■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 FBXL5Q9UKA1 691 aa29.18■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 C19orf67A6NJJ6 358 aa29.17■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 ITGB3P05106 788 aa29.17■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 SP100P23497 879 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 ROR1Q01973 937 aa29.17■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 CES5AQ6NT32 575 aa29.17■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 SENP8Q96LD8 212 aa29.17■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 TTC28Q96AY4 2481 aa29.16■■■□□ 2.26
TPGS1-201ENST00000359315 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
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