RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349139.5

WDR3-201, Transcript of WD repeat domain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene WDR3, Length 9,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR3-201ENST00000349139 SERPINB4P48594 390 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 STX3Q13277 289 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 CYTH1Q15438 398 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 PI16Q6UXB8 463 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 BLIDQ8IZY5 108 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 CAPNS2Q96L46 248 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 RILPQ96NA2 401 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 SLITRK1Q96PX8 696 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 MINPP1Q9UNW1 487 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 TMEM5Q9Y2B1 443 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 RRN3P2A6NIE6 340 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 MEIS1O00470 390 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 HSMCR30P0CW71 290 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 SMARCA1P28370 1054 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 RAB27AP51159 221 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 HDAC4P56524 1084 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 PLIN5Q00G26 463 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 TWF1Q12792 350 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 NFIXQ14938 502 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 ACAP2Q15057 778 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 FSCBQ5H9T9 825 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 KLC3Q6P597 504 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 STAG2Q8N3U4 1231 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 OSCP1Q8WVF1 389 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 TLE6Q9H808 572 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 CAPN10Q9HC96 672 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 NLRC4Q9NPP4 1024 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 TNFSF13BQ9Y275 285 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 ADGRB1O14514 1584 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 NOTOA8MTQ0 251 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 E9PMD0 336 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 KRT86O43790 486 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 WBP4O75554 376 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 TIPRLO75663 272 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 PRKACAP17612 351 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 AVPR1AP37288 418 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 TRPC1P48995 793 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 ZBED6P86452 979 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 HLFQ16534 295 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 SYCP2LQ5T4T6 812 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 RGMBQ6NW40 437 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 CCDC3Q9BQI4 270 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 TRIM54Q9BYV2 358 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 POLE3Q9NRF9 147 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 ERAP1Q9NZ08 941 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 RASSF9O75901 435 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 CKMP06732 381 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 GJB1P08034 283 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 LCP1P13796 627 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 PPP3CCP48454 512 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 ATP1A2P50993 1020 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 CENPCQ03188 943 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.932e-9■■□□□ 11.7
WDR3-201ENST00000349139 BEND3Q5T5X7 828 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 TMEM53Q6P2H8 277 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 CHMP1BQ7LBR1 199 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 RD3Q7Z3Z2 195 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 SUN3Q8TAQ9 357 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 MKL1Q969V6 931 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 ERP27Q96DN0 273 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 EPAS1Q99814 870 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 DBNDD2Q9BQY9 259 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 ECT2Q9H8V3 914 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 FANCEQ9HB96 536 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 HPS4Q9NQG7 708 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 STK39Q9UEW8 545 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 ASIC3Q9UHC3 531 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 AXIN2Q9Y2T1 843 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 POMCP01189 267 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 FDX1P10109 184 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 MCAMP43121 646 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 PSMC5P62195 406 aa2.99□□□□□ -1.93
WDR3-201ENST00000349139 CDH18Q13634 790 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms