RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309576.10

PPARG-202, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene PPARG, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-202ENST00000309576 CEP290O15078 2479 aa21.43■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 HOXA2O43364 376 aa21.43■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 UPP2O95045 317 aa21.43■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 AMHP03971 560 aa21.43■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 DSC1Q08554 894 aa21.43■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 TRPC3Q13507 836 aa21.43■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.43■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.43■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 NUP58Q9BVL2 599 aa21.43■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.43■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.43■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 DDHD2O94830 711 aa21.42■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 CASP14P31944 242 aa21.42■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.42■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21.42■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.42■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.42■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 COL4A6Q14031 1691 aa21.42■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 A0A1W2PQJ5 194 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 ATICP31939 592 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 TUSC3Q13454 348 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 IQCEQ6IPM2 695 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 ABI1Q8IZP0 508 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 LRRC52Q8N7C0 313 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 URGCPQ8TCY9 931 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 HERVK_113Q902F9 699 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 BAP1Q92560 729 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 TAF4BQ92750 862 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 KAT5Q92993 513 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 CLCNKBP51801 687 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 UPP1Q16831 310 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 WDR44Q5JSH3 913 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 RRAGAQ7L523 313 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 CPLX3Q8WVH0 158 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 RSPH1Q8WYR4 309 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 IQCDQ96DY2 449 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 HPDLQ96IR7 371 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 NT5C1BQ96P26 610 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 CEP72Q9P209 647 aa21.41■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 LAMA3Q16787 3333 aa21.4■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.4■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 SPTLC1O15269 473 aa21.4■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 TRIM14Q14142 442 aa21.4■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 ZNF699Q32M78 642 aa21.4■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.4■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.4■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.4■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.39■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 RPL9P32969 192 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 KCNJ6P48051 423 aa21.39■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 GCNT1Q02742 428 aa21.39■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.39■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.39■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 RASIP1Q5U651 963 aa21.39■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.39■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 ARID3AQ99856 593 aa21.39■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.39■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 GPR88Q9GZN0 384 aa21.39■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.39■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 HCSTQ9UBK5 93 aa21.39■■□□□ 1.02
PPARG-202ENST00000309576 ZBBXA8MT70 800 aa21.39■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 PODXLO00592 558 aa21.39■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 ASPAP45381 313 aa21.39■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 JAM2P57087 298 aa21.39■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.39■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 CD300LGQ6UXG3 332 aa21.39■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.39■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 TC2NQ8N9U0 490 aa21.39■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 RABGGTAQ92696 567 aa21.39■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.39■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.39■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 MFAP3LO75121 409 aa21.38■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 RFX1P22670 979 aa21.38■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 ADKP55263 362 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 LILRA4P59901 499 aa21.38■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 ARID5BQ14865 1188 aa21.38■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.38■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 GJB5O95377 273 aa21.37■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 ZBED6P86452 979 aa21.37■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 MYO1EQ12965 1108 aa21.37■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 CUL2Q13617 745 aa21.37■■□□□ 1.01
PPARG-202ENST00000309576 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms