RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267328.4

RAB20-201, Transcript of RAB20, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB20, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20-201ENST00000267328 P4HA2O15460 535 aa25.49■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 DNAJB2P25686 324 aa25.49■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 PBX3P40426 434 aa25.49■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 RBP5P82980 135 aa25.49■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 TAP1Q03518 808 aa25.49■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 SCARA3Q6AZY7 606 aa25.49■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 SAMD11Q96NU1 681 aa25.49■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 COLEC11Q9BWP8 271 aa25.49■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa25.49■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 MARCH5Q9NX47 278 aa25.49■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 TAB2Q9NYJ8 693 aa25.49■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 COQ4Q9Y3A0 265 aa25.49■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 PPEF2O14830 753 aa25.48■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 PHACTR2O75167 634 aa25.48■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 KIF4AO95239 1232 aa25.48■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 VNN1O95497 513 aa25.48■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 CST3P01034 146 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 SLC39A11Q8N1S5 342 aa25.48■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 LRRC52Q8N7C0 313 aa25.48■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 C3orf58Q8NDZ4 430 aa25.48■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 RABGGTAQ92696 567 aa25.48■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 RBSNQ9H1K0 784 aa25.48■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 NDST4Q9H3R1 872 aa25.48■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 AGAP1Q9UPQ3 857 aa25.48■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa25.48■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.48■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 KRT19P08727 400 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 BMPR1AP36894 532 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 MYL7Q01449 175 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 NCOA4Q13772 614 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 CD300LGQ6UXG3 332 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 TAS1R2Q8TE23 839 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 ZNF560Q96MR9 790 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 PLVAPQ9BX97 442 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 C5orf67F2Z3F1 127 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 F8W810 466 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 B3GAT3O94766 335 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 STAU1O95793 577 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 HLA-DRAP01903 254 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 TPM2P07951 284 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 PPM1AP35813 382 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 PNPLA4P41247 253 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 ERVK-21P61565 698 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 TRPC3Q13507 836 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 FBXL13Q8NEE6 735 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 TIFAQ96CG3 184 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 IGSF21Q96ID5 467 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 C17orf80Q9BSJ5 609 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 VPS16Q9H269 839 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 CHD9Q3L8U1 2897 aa25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 ITGB1P05556 798 aa25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 PAX3P23760 479 aa25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 ATICP31939 592 aa25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 CTNNB1P35222 781 aa25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 PIK3CAP42336 1068 aa25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 EPC2Q52LR7 807 aa25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 PPP2R2DQ66LE6 453 aa25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 SPRED2Q7Z698 418 aa25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 VRTNQ9H8Y1 702 aa25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 SLC28A3Q9HAS3 691 aa25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 SPG21Q9NZD8 308 aa25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 ADAM28Q9UKQ2 775 aa25.46■■□□□ 1.67
RAB20-201ENST00000267328 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 RB1P06400 928 aa25.45■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 TAF6P49848 677 aa25.45■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 LILRA4P59901 499 aa25.45■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 CETN1Q12798 172 aa25.45■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 XYLT2Q9H1B5 865 aa25.45■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 RAB20Q9NX57 234 aa25.45■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 EFEMP2O95967 443 aa25.44■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 MYL6P60660 151 aa25.44■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 PLCB3Q01970 1234 aa25.44■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 SV2CQ496J9 727 aa25.44■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 HASPINQ8TF76 798 aa25.44■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 SEMA4DQ92854 862 aa25.44■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa25.44■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 CHD7Q9P2D1 2997 aa25.44■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 LGALS16A8MUM7 142 aa25.43■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 SPTLC1O15269 473 aa25.43■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 TADA2AO75478 443 aa25.43■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 ASS1P00966 412 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 MYO1EQ12965 1108 aa25.43■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa25.43■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 TAF4BQ92750 862 aa25.43■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 TMEM169Q96HH4 297 aa25.43■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 HPDLQ96IR7 371 aa25.43■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 NUB1Q9Y5A7 615 aa25.43■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 PES1O00541 588 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 FGF18O76093 207 aa25.42■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 FANCCQ00597 558 aa25.42■■□□□ 1.66
RAB20-201ENST00000267328 FUT10Q6P4F1 479 aa25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms