RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225298.11

UTP18-201, Transcript of UTP18, small subunit processome component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UTP18, Length 1,894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18-201ENST00000225298 C2CD2Q9Y426 696 aa20.22■□□□□ 0.83
UTP18-201ENST00000225298 CES2O00748 559 aa20.21■□□□□ 0.83
UTP18-201ENST00000225298 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
UTP18-201ENST00000225298 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.21■□□□□ 0.83
UTP18-201ENST00000225298 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.21■□□□□ 0.83
UTP18-201ENST00000225298 JADE1Q6IE81 842 aa20.21■□□□□ 0.83
UTP18-201ENST00000225298 SLFN11Q7Z7L1 901 aa20.21■□□□□ 0.83
UTP18-201ENST00000225298 TMEM192Q8IY95 271 aa20.21■□□□□ 0.83
UTP18-201ENST00000225298 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.21■□□□□ 0.83
UTP18-201ENST00000225298 PBKQ96KB5 322 aa20.21■□□□□ 0.83
UTP18-201ENST00000225298 MMS19Q96T76 1030 aa20.21■□□□□ 0.83
UTP18-201ENST00000225298 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
UTP18-201ENST00000225298 ACP6Q9NPH0 428 aa20.21■□□□□ 0.83
UTP18-201ENST00000225298 ZNF185O15231 689 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 NPTXRO95502 500 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 MYBL1P10243 752 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 ITIH3Q06033 890 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CREG2Q8IUH2 290 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CREBZFQ9NS37 354 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 KIF4AO95239 1232 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 NFICP08651 508 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 FGFR4P22455 802 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 ZNF653Q96CK0 615 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 PSMB7Q99436 277 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 OSGEPQ9NPF4 335 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 DERAQ9Y315 318 aa20.2■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 THAP12O43422 761 aa20.19■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 MCM3P25205 808 aa20.19■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CXCR5P32302 372 aa20.19■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 COG1Q8WTW3 980 aa20.19■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.19■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CISHQ9NSE2 258 aa20.19■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.19■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 HOXC8P31273 242 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 NKX3-2P78367 333 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 RBP5P82980 135 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 SNX17Q15036 470 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 LIN9Q5TKA1 542 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 KCNK3O14649 394 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 PGK1P00558 417 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 ITGB3P05106 788 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CD58P19256 250 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 DNA2P51530 1060 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 TTC39CQ8N584 583 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 KIF12Q96FN5 646 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.18■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 MTA2O94776 668 aa20.17■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CYP1A2P05177 515 aa20.17■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.17■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.17■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 UBR7Q8N806 425 aa20.17■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.17■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 DPP3Q9NY33 737 aa20.17■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.17■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 MYADML2A6NDP7 307 aa20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 MYO1EQ12965 1108 aa20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 HIC1Q14526 733 aa20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 ARHGEF6Q15052 776 aa20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CLUL1Q15846 466 aa20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 CEP83Q9Y592 693 aa20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 MED7O43513 233 aa20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 ERLIN1O75477 346 aa20.16■□□□□ 0.82
UTP18-201ENST00000225298 GNRH1P01148 92 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms