RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hectd2Q8CDU6 774 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdhb12Q91Y07 789 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdha10Q91Y20 946 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttc1Q91Z38 292 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pgm1Q9D0F9 562 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem81Q9D5K1 259 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl2Q9D773 306 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sv2aQ9JIS5 742 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp39a1Q9JKJ9 470 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CtsfQ9R013 462 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clcn2Q9R0A1 908 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prmt2Q9R144 448 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mical3Q8CJ19 1993 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taf4bG5E8Z2 855 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CaluO35887 315 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Banf1O54962 89 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RpsaP14206 295 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pde6bP23440 856 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccng1P51945 294 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dab2P98078 766 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Upf3bQ3ULL6 472 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sp4Q62445 782 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GapdhsQ64467 440 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prr18Q6PAN7 307 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc117Q6PB51 277 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sap130Q8BIH0 1057 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ldlrap1Q8C142 308 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem161bQ8C2L6 487 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pnpt1Q8K1R3 783 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Angel1Q8VCU0 667 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mphosph6Q9D1Q1 161 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PrameQ9D4Z5 464 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tll2Q9WVM6 1012 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btaf1E9QAE3 1848 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cntnap5cQ0V8T7 1305 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm9774A0A0A6YVU8 407 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr310B2RVZ1 332 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spata31d1dE9Q5W2 1247 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp457L7N1X4 647 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NsfP46460 744 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cav1P49817 178 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rhox5P52651 210 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbc1d10aP58802 500 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NfibP97863 570 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm4952Q5FW57 296 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tcf4Q60722 670 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gstt2Q61133 244 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Parp6Q6P6P7 630 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankfy1Q810B6 1169 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vgll2Q8BGW8 322 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sh2d5Q8JZW5 429 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim68Q8K243 485 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dppa3Q8QZY3 150 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MgarpQ8VI64 283 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Terb2Q9D494 218 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PygmQ9WUB3 842 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bcorl1A2AQH4 1781 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sbf2E9PXF8 1872 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf536Q8K083 1302 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SktA2AQ25 1946 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Card9A2AIV8 536 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21973F6WEZ7 68 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kif5aP33175 1027 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tulp2P46686 562 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sem1P60897 70 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RilpQ5ND29 369 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp3a11Q64459 504 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smg5Q6ZPY2 1017 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpinb13Q8CDC0 389 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Emilin2Q8K482 1074 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 WaslQ91YD9 501 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cuedc2Q9CXX9 284 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mettl1Q9Z120 268 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cib2Q9Z309 187 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp612A0A1D5RMC2 672 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prdm11A2AGX3 565 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vwa5b1A9Z1V5 1215 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eef1bO70251 225 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itgb5O70309 798 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col9a2Q07643 688 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfyve27Q3TXX3 415 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 D630036H23RikQ3UQD6 204 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc110Q3V125 848 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rhot1Q8BG51 631 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Camkk2Q8C078 588 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rtp1Q8C8C1 263 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stxbp5Q8K400 1152 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 OlahQ8R197 265 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sec63Q8VHE0 760 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdk5rap3Q99LM2 503 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tlr3Q99MB1 905 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab11fip1Q9D620 645 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 H2-OaQ9QWV1 250 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.1 ms