RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tube1Q9D6T1 475 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc144bE9PVZ3 520 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp8b1Q148W0 1251 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tgfbrap1Q3UR70 860 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q6GQV0 436 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr670Q7TRP3 312 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tada3Q8R0L9 432 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vwa1Q8R2Z5 415 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnajc19Q9CQV7 116 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Taf7lQ9D3R9 471 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dcaf6Q9DC22 876 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EtfbQ9DCW4 255 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Homer2Q9QWW1 354 aa13.52□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp358E9Q8M1 571 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tlk2O55047 718 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AlbP07724 608 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ZfxP17012 799 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nub1P54729 614 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nol4P60954 483 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nat8lQ3UGX3 299 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Armc7Q3UJZ3 198 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Afg1lQ3V384 480 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrig3Q6P1C6 1117 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Frmd4aQ8BIE6 1020 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Txndc5Q91W90 417 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 St13Q99L47 371 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Maged2Q9ER67 616 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Anxa9Q9JHQ0 345 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnajc7Q9QYI3 494 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sept5Q9Z2Q6 369 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbkbp1A2A9T0 611 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MtrA6H5Y3 1253 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm16430A6X8J1 155 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rgs22G3UYX5 1258 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sh3bp1P55194 680 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpina1eQ00898 413 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc39dQ0VF76 604 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 OtulinQ3UCV8 352 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spata20Q80YT5 790 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gdap1l1Q8VE33 370 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rabep2Q91WG2 554 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SerhlQ9EPB5 311 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gcnt4E9Q649 455 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp597E9Q6S0 419 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Capn2O08529 700 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EsrraO08580 422 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atxn10P28658 475 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wfs1P56695 890 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr8Q60892 310 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atg9bQ6EBV9 922 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pan2Q8BGF7 1200 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tasp1Q8R1G1 420 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2c50Q91X77 490 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Osbpl1aQ91XL9 950 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trmt11Q9CWH5 460 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Creld2Q9CYA0 350 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snx29Q9D3S3 818 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GOLGA7BQ9D428 167 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LactbQ9EP89 551 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tspan3Q9QY33 253 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd97Q9Z0M6 818 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mon2Q80TL7 1715 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Drp2Q05AA6 957 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gxylt1Q3UHH8 404 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mamdc2Q8CG85 686 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ankef1Q9D2J7 775 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DtnaQ9D2N4 746 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Calr3Q9D9Q6 380 aa13.51□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr743L7N1Y2 311 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Odc1P00860 461 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccnd3P30282 292 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vsnl1P62761 191 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Uhmk1P97343 419 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stx2Q00262 289 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sgms1Q8VCQ6 419 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snf8Q9CZ28 258 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cops5O35864 334 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prl2c2P04095 224 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbx3P70324 741 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ap5z1Q3U829 807 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrn2Q6PHP6 730 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TdrkhQ80VL1 560 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bpifb6Q8BU51 449 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc159Q8C963 411 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lamtor4Q8CF66 99 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smtnl2Q8CI12 456 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cadm1Q8R5M8 456 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 M1apQ9Z0E1 529 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psma2P49722 234 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rasgrf2P70392 1189 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ogfod1Q3U0K8 545 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RbakQ8BQC8 711 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psma8Q9CWH6 250 aa13.5□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rhox3cA2AWM0 215 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rhox3hL7MU37 215 aa13.49□□□□□ -0.25
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpinb9O08797 374 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.5 ms