RNA–Protein interactions for RNA: YOR168W

GLN4, Transcript of Glutamine tRNA synthetase, yeast

Gene GLN4, Length 2,430 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GLN4	YOR168W	CDC7	P06243	507 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	SPL2	P38839	148 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	APQ12	P40532	138 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	MEP2	P41948	499 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	VPS25	P47142	202 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	SDT1	P53078	280 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	YGR035C	P53222	116 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	SDH7	Q04401	133 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	IES4	Q08561	116 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	YOR292C	Q08743	309 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	YLR112W	Q12130	139 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	MDM32	Q12171	622 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GLN4	YOR168W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	TRS65	P32893	560 aa		3.59	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	NKP2	Q06162	153 aa		3.59	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	BSP1	Q06604	576 aa		3.59	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	AIM39	Q08223	395 aa		3.59	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	PCL9	Q12477	304 aa		3.59	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	DRS2	P39524	1355 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	PEX34	P25584	144 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	CSH1	P38287	376 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	MTC6	P38849	526 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	RFC2	P40348	353 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	PAC10	P48363	199 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	NRM1	P53718	249 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	PLP1	Q04004	230 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	MRX8	Q05473	314 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	YDR278C	Q05612	105 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	DGA1	Q08650	418 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	IES3	Q12345	250 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	STE7	P06784	515 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	SNF4	P12904	322 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	HYM1	P32464	399 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	VMA7	P39111	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	AVT7	P40501	490 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	LCB3	P47013	409 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	ERV29	P53337	310 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	BOR1	P53838	576 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	YDR391C	Q04170	232 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	ATP14	Q12349	124 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	YBR220C	P38318	560 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	RPA43	P46669	326 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	TFC7	Q12415	435 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	BUD4	P47136	1447 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	MSI1	P13712	422 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	SPO13	P23624	291 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	ATG22	P25568	528 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	MRPL39	P36533	70 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	MIX23	P38162	196 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	CAB4	P53332	305 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	SLM2	P53955	656 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	YDR124W	Q04608	324 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	SUE1	Q06524	206 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	RTR2	Q12378	196 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	PSK1	P31374	1356 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	PHO13	P19881	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	PEX2	P32800	271 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	PTM1	P32857	523 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	COX14	P39103	70 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	YGR018C	P53211	109 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	FMP48	P53233	369 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	PGA1	P53896	198 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	AAH1	P53909	347 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	SAE3	P89114	91 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	DML1	Q03652	475 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	VHS1	Q03785	461 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	CNL1	Q06333	122 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	SIR2	P06700	562 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	STP22	P25604	385 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GLN4	YOR168W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected

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