RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A EGD2P38879 174 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A SEC72P39742 193 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YER034WP40022 185 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A IRC18P47056 224 aa1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YJL016WP47072 561 aa1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YJR149WP47177 404 aa1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A BXI1P48558 297 aa1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A RMR1P53060 241 aa1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A NOP19P53317 196 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YPL039WQ03080 316 aa1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YMD8Q03697 442 aa1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YDR248CQ03786 193 aa1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A EMI1Q04406 187 aa1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YET3Q07451 203 aa1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YOR186WQ08560 144 aa1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A TPO4Q12256 659 aa1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A SMT3Q12306 101 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A CMC2Q3E7A4 109 aa1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YBL112CQ3E7Y4 105 aa1.01□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A FBA1P14540 359 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A ERD2P18414 219 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A APA2P22108 325 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A DBF2P22204 572 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A RAD51P25454 400 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A EHD3P28817 500 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A ERG24P32462 438 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A APS1P35181 156 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A ECM13P38195 257 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data1□□□□□ -2.25not detected
YHL009W-AYHL009W-A YAR068WP39564 161 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YER189WP40104 122 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A PEX17P40155 199 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A BMT5P40493 336 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A MMS2P53152 137 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A PRM8P53174 237 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YGL034CP53186 121 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A ERV29P53337 310 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A COS6P53344 381 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YNL046WP53956 172 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A SNZ1Q03148 297 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YML096WQ04489 525 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A FAR8Q05040 523 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YPL257WQ08974 193 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A MDM32Q12171 622 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A BBP1Q12365 385 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YOR020W-AQ3E824 90 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A HTL1Q9URQ5 78 aa1□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YLR462WO13556 202 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A QCR7P00128 127 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A CDC28P00546 298 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A RPL25P04456 142 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A DSF1P0CX08 502 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YNR073CP0CX09 502 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A GCN3P14741 305 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A ADE1P27616 306 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A ARC19P33204 171 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A VPS51P36116 164 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A ECM4P36156 370 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A COS8P38723 381 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A DOG2P38773 246 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A DOG1P38774 246 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A AST2P39945 430 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YEL075CP39972 122 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A RMD6P39975 231 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A FIS1P40515 155 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A CAT5P41735 233 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YGL159WP53110 370 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A TOS8P53147 276 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A PDR17P53844 350 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A RTC4P53850 401 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A ABF2Q02486 183 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A PRM15Q03262 622 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YMR279CQ03263 540 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YLR036CQ07986 203 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YPL247CQ12523 523 aa0.99□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A QCR6P00127 147 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YPR170W-BP0C5R9 85 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A COS2P0CX12 379 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A COS3P0CX13 379 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A TRR1P29509 319 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A OAC1P32332 324 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A PTM1P32857 523 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A RCN1P36054 211 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A MSA2P36157 363 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A SKG1P36169 355 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A SHG1P38337 142 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A HMF1P40037 129 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data0.98□□□□□ -2.25not detected
YHL009W-AYHL009W-A FAR7P43592 221 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YFR054CP43622 192 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YJR056CP47115 236 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A MDM34P53083 459 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A GTR2P53290 341 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YLR030WQ07967 263 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A YNG1Q08465 219 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A MSA1Q08471 629 aa0.98□□□□□ -2.25
YHL009W-AYHL009W-A GEP5Q12393 293 aa0.98□□□□□ -2.25
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