RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W MCH1Q07376 486 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W THI20Q08224 551 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PRR2Q12310 699 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W VMA9Q3E7B6 73 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YIL134C-AQ45U18 67 aa3.06□□□□□ -1.92
VFA1YER128W VMR1P38735 1592 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RAD52P06778 471 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ADH3P07246 375 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W CTA1P15202 515 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RPB3P16370 318 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W CPT1P17898 393 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PHO80P20052 293 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W EPT1P22140 391 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ATG15P25641 520 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SRY1P36007 326 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W TRM7P38238 310 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W FLO5P38894 1075 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YAL037WP39728 267 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YER188WP40103 239 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W TIF34P40217 347 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W COA1P40452 197 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YIL060WP40519 144 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YPS6P40583 537 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W HAC1P41546 238 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data3.05□□□□□ -1.92not detected
VFA1YER128W DPB11P47027 764 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W XPT1P47165 209 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MIC26P50087 233 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W CDH1P53197 566 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W IBD2P53892 351 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W UBP16Q02863 499 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W LIP2Q06005 328 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W TEN1Q07921 160 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MMT2Q08970 484 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YPR027CQ12079 277 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ERP3Q12403 225 aa3.05□□□□□ -1.92
VFA1YER128W UBR1P19812 1950 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YDR157WA0A023PZE8 133 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W BI2P03873 423 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ADK1P07170 222 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W GDH1P07262 454 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PEP4P07267 405 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SEC4P07560 215 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YPR170W-BP0C5R9 85 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W BGL2P15703 313 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W FCY2P17064 533 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PDE1P22434 369 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W HYP2P23301 157 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SCO1P23833 295 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MGT1P26188 188 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W INO2P26798 304 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RAD23P32628 398 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W EMP24P32803 203 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SFC1P33303 322 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W FRM2P37261 193 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W VID24P38263 362 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MTC4P38335 694 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SRP68P38687 599 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YHR033WP38690 423 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ARN2P38724 620 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RPL14BP38754 138 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YHR210CP38893 341 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W IPT1P38954 527 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YEL075CP39972 122 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SYS1P41544 203 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W AZF1P41696 914 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MTM1P53320 366 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RHO4Q00246 291 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W CYT2Q00873 224 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RSM23Q01163 450 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W IZH1Q03419 316 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W RCE1Q03530 315 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W HSP31Q04432 237 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PRM6Q04705 352 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MRX8Q05473 314 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W HRD3Q05787 833 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YLR030WQ07967 263 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W CSI2Q08054 341 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W COQ10Q08058 207 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YOL131WQ08270 108 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PEX27Q08580 376 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SRL1Q08673 210 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W NDD1Q08887 554 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PFA4Q12006 378 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W NUS1Q12063 375 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W HUT1Q12520 339 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa3.04□□□□□ -1.92
VFA1YER128W YNR034W-AQ3E841 98 aa3.04□□□□□ -1.92
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