RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638873.1

SPIN3-215, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene SPIN3, Length 3,221 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-215ENST00000638873 FOSP01100 380 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 SREBF1P36956 1147 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 NR1H3Q13133 447 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 MOGSQ13724 837 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 TTLL6Q8N841 843 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 BBOF1Q8ND07 529 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 TTC8Q8TAM2 541 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 EPS8L1Q8TE68 723 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 C9orf72Q96LT7 481 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 VCXQ9H320 206 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 CNGA1P29973 690 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 LRRC8CQ8TDW0 803 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 DCLRE1BQ9H816 532 aa13.07□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 CBX6O95503 412 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 DLG4P78352 724 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 CCDC6Q16204 474 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 ZNF365Q70YC5 407 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 SLC9A9Q8IVB4 645 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 ATL2Q8NHH9 583 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 SPOCK2Q92563 424 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 DYDC2Q96IM9 177 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 FIZ1Q96SL8 496 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 SYT15Q9BQS2 421 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 DCLK3Q9C098 648 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 TUFT1Q9NNX1 390 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 UBN1Q9NPG3 1134 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 STOML1Q9UBI4 398 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 ENTPD5O75356 428 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 T-ENOLP0DO92 83 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 GCLMP48507 274 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 TUBP50607 506 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 RAB27AP51159 221 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 VAMP7P51809 220 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 RASA3Q14644 834 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 TMEM63BQ5T3F8 832 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 SUPT20HQ8NEM7 779 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 KAT5Q92993 513 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 AMNQ9BXJ7 453 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 USP20Q9Y2K6 914 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 P4HA2O15460 535 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 CYP26A1O43174 497 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 CHMP2AO43633 222 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 MARK3P27448 753 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 PTPN4P29074 926 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 CIITAP33076 1130 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 SHMT1P34896 483 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 CYP4F22Q6NT55 531 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 TRABD2AQ86V40 505 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 CYP2W1Q8TAV3 490 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 MAML1Q92585 1016 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 HSD17B14Q9BPX1 270 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 ZFP69BQ9UJL9 534 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 NVLO15381 856 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 EDF1O60869 148 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 PPP3CAQ08209 521 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 USH1GQ495M9 461 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 IZUMO3Q5VZ72 239 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 IRGCQ6NXR0 463 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 RGS9BPQ6ZS82 235 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 CEP128Q6ZU80 1094 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 SLC47A2Q86VL8 602 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 CFAP57Q96MR6 1250 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 TRABDQ9H4I3 376 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 PCIF1Q9H4Z3 704 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 EURLQ9NYK6 297 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 ZNF831Q5JPB2 1677 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 COL24A1Q17RW2 1714 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 ZBTB39O15060 712 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 SLITRK3O94933 977 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 SP100P23497 879 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 RRM1P23921 792 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 CRKP46108 304 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 SESN3P58005 492 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 FMO1Q01740 532 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 MYBPC2Q14324 1141 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 PDK4Q16654 411 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 EPC2Q52LR7 807 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 PRUNE1Q86TP1 453 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 FAM71AQ8IYT1 594 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 CCDC89Q8N998 374 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 C10orf82Q8WW14 230 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 TEKT1Q969V4 418 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 SMC6Q96SB8 1091 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 ACP6Q9NPH0 428 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-215ENST00000638873 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.321e-18■■■■■ 447.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms