RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636773.1

CACNB4-233, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 4,143 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-233	ENST00000636773	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773		A0A0D9SFI3	127 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	NDC80	O14777	642 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	ZW10	O43264	779 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	KATNA1	O75449	491 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	PCNA	P12004	261 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	PCSK1	P29120	753 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	PMS2	P54278	862 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	OXCT1	P55809	520 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	DAB2	P98082	770 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	CREM	Q03060	361 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	GRIK4	Q16099	956 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	LUZP1	Q86V48	1076 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	SLC9A7	Q96T83	725 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	OCEL1	Q9H607	264 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773		A0A1W2PQ67	120 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	MYMK	A6NI61	221 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	MEI4	A8MW99	385 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	DNM1L	O00429	736 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	NMT2	O60551	498 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	PRKCB	P05771	671 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	CHKA	P35790	457 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	PPARD	Q03181	441 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	COL19A1	Q14993	1142 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	INA	Q16352	499 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	KYAT1	Q16773	422 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	GJA10	Q969M2	543 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	ELP1	O95163	1332 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	POMC	P01189	267 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	APOE	P02649	317 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	CFI	P05156	583 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	INSRR	P14616	1297 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	CLCN3	P51790	818 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	PLD1	Q13393	1074 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	PLPP6	Q8IY26	295 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	CERS5	Q8N5B7	392 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	ACCS	Q96QU6	501 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	TBCB	Q99426	244 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	MUC3B	Q9H195	1237 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	ZWILCH	Q9H900	591 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-233	ENST00000636773	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65

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