RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC53	A6NM62	1247 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SLC16A4	O15374	487 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PPFIA2	O75334	1257 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	AGT	P01019	485 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	RARA	P10276	462 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MSH2	P43246	934 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CYP2J2	P51589	502 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	RPS6KA1	Q15418	735 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	BAP1	Q92560	729 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	KLHL29	Q96CT2	875 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ECT2	Q9H8V3	914 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CEP72	Q9P209	647 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ARID2	Q68CP9	1835 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	BTBD19	C9JJ37	291 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	BUB1	O43683	1085 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SUN1	O94901	812 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CHN1	P15882	459 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ALDH3A1	P30838	453 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CCNA1	P78396	465 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	BNIP1	Q12981	228 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	LAMB3	Q13751	1172 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	RRAGA	Q7L523	313 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SLC35C1	Q96A29	364 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PORCN	Q9H237	461 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	VCX	Q9H320	206 aa		16.35	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	NOL4	O94818	638 aa		16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GGPS1	O95749	300 aa		16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OAT	P04181	439 aa		16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GNAT1	P11488	350 aa		16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MXRA7	P84157	204 aa		16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MORC4	Q8TE76	937 aa		16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ASB3	Q9Y575	518 aa		16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	16.34	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	EVI5	O60447	810 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	EXOC3	O60645	756 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SETSIP	P0DME0	302 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	NPTX2	P47972	431 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	RTP1	P59025	263 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CLUL1	Q15846	466 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	LY6K	Q17RY6	165 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MTERF2	Q49AM1	385 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	METTL7B	Q6UX53	244 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	16.33	■□□□□ 0.21	7e-7	■□□□□ 9.9
BBS1-225	ENST00000630659	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		16.33	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	SNX3	O60493	162 aa		16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	ATP5H	O75947	161 aa		16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	ATP6V1C1	P21283	382 aa		16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	SLC18A3	Q16572	532 aa		16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	SESTD1	Q86VW0	696 aa		16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	BSND	Q8WZ55	320 aa		16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	PCYT2	Q99447	389 aa		16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	16.32	■□□□□ 0.2

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