RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615596.1

GTF2I-216, Transcript of general transcription factor IIi, humanhuman

TSL 2

Gene GTF2I, Length 717 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2I-216ENST00000615596 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 GPR65Q8IYL9 337 aa14.95□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.95□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.95□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.95□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.95□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 CD207Q9UJ71 328 aa14.95□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 PODXLO00592 558 aa14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 KLRC4O43908 158 aa14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 IL9P15248 144 aa14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 GARTP22102 1010 aa14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 RTP2Q5QGT7 225 aa14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 CD302Q8IX05 232 aa14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 CASP10Q92851 521 aa14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 MUC3AQ02505 3323 aa14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 TTC28Q96AY4 2481 aa14.94□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 DLL1O00548 723 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 TEX28O15482 410 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 MBTPS2O43462 519 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 ZNF202O95125 648 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 MYL1P05976 194 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 EPCAMP16422 314 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 KLRC2P26717 231 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 TMEM130Q8N3G9 435 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 TTPALQ9BTX7 342 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 ASB7Q9H672 318 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 I3L4J1 428 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 TRAPPC3O43617 180 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 ADH1AP07327 375 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 NFICP08651 508 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 CYP3A5P20815 502 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 FGFR3P22607 806 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 LRPAP1P30533 357 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 BRCC3P46736 316 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 CLCN4P51793 760 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 JADE1Q6IE81 842 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 CEP57Q86XR8 500 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 SAAL1Q96ER3 474 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 S1PR5Q9H228 398 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 FNIP2Q9P278 1114 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 FAM50BQ9Y247 325 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 DERAQ9Y315 318 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 UBE4BO95155 1302 aa14.92□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 TGFB1I1O43294 461 aa14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 EXTL3O43909 919 aa14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 GUCY2FP51841 1108 aa14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 STK4Q13043 487 aa14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 PSMD2Q13200 908 aa14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 SPATA1Q5VX52 437 aa14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GTF2I-216ENST00000615596 APOL5Q9BWW9 433 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms