RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605910.1

TRAM2-AS1-202, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 1,053 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF592Q92610 1267 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LPPQ93052 612 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF558Q96NG5 402 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 APOL6Q9BWW8 343 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GBP3Q9H0R5 595 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CWH43Q9H720 699 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RNF19AQ9NV58 838 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SNTG2Q9NY99 539 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HES2Q9Y543 173 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RECQL4O94761 1208 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 AKAP5P24588 427 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CTNNB1P35222 781 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MLH1P40692 756 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PLCB3Q01970 1234 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NR1H3Q13133 447 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 XKR4Q5GH76 650 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SPATA20Q8TB22 786 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SMARCE1Q969G3 411 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 UROC1Q96N76 676 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GAD1Q99259 594 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MSTO1Q9BUK6 570 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TBC1D13Q9NVG8 400 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LZTS1Q9Y250 596 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 USP20Q9Y2K6 914 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GDAQ9Y2T3 454 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ANKRD63C9JTQ0 380 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 POMCP01189 267 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ADRB2P07550 413 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KCNE1P15382 129 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 JUNDP17535 347 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PTMSP20962 102 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 IGFBP4P22692 258 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CASP1P29466 404 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GATMP50440 423 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MMP16P51512 607 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CASP5P51878 434 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 BCAR1P56945 870 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TFF2Q03403 129 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PPP2R3AQ06190 1150 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 STK4Q13043 487 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GPM6BQ13491 265 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MYBPC2Q14324 1141 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ARMCX5Q6P1M9 558 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LRRC55Q6ZSA7 311 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 C12orf56Q8IXR9 622 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ASB7Q9H672 318 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SPG21Q9NZD8 308 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CNTN3Q9P232 1028 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DERAQ9Y315 318 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PDXKO00764 312 aa9.95□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CALUO43852 315 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EXTL3O43909 919 aa9.95□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DXOO77932 396 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 IL18RAPO95256 599 aa9.95□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GALTP07902 379 aa9.95□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LINC00271P0C7V0 271 aa9.95□□□□□ -0.82
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms